本家様 http://www.2dx.unibas.ch/

表紙には「Focus - High Throughput Electron Microscopy Image Processing Software」とある
「Screen Shots」を見ると Pipeline Pilot、KNIMEっぽいことができるのかなって期待してしまう 真偽は不明

入手

サイトにてアカウント登録を行ってrpmファイルを取得したが、依存問題を解決できなかったので github 版を使います
CentOS 7なら

[root@c src]# yum install qt5-qtbase-devel qt5-qtscript-devel
[root@c src]# export PATH=/usr/lib64/qt5/bin:/bin:/usr/bin
 
[root@c src]# git clone https://github.com/C-CINA/focus.git
[root@c src]# cd focus/
[root@c focus]# git log -1
commit e659a3bba42b448093482802d5798cbd0330b147
Merge: fcdcc4b 8bd4582
Author: CINA <cina@bs-zorro01.ethz.ch>
Date:   Mon Feb 13 14:13:53 2017 +0100
 
    Merge branch 'master' of https://github.com/C-CINA/focus
 
[root@c focus]# mkdir 170213 && cd 170213
 
[root@c 170213]# cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/Appl/Focus .. -L
[root@c 170213]# make && make install

CentOS6ではgccが古いので不可
っで、新しいコンパイラを組み上げて、再度チャレンジ。その場合、「-DCMAKE_CXX_COMPILER」とかで指摘が必要

[root@c ~]# cd /Appl/src/focus/
[root@c focus]# mkdir 170215 && cd 170215
 
[root@c 170215]# export PATH=/usr/lib64/qt5/bin:/Appl/local/gcc494/bin:/usr/local/cuda:/bin:/usr/bin
[root@c 170215]# export LD_LIBRARY_PATH=/Appl/local/lib:/usr/local/cuda/lib64
 
[root@c 170215]# cmake -DCMAKE_CXX_COMPILER=/Appl/local/gcc494/bin/g++ \
                       -DCMAKE_C_COMPILER=/Appl/local/gcc494/bin/gcc \
                       -DFFTWD_LIB=/Appl/local/lib/libfftw3.so \
                       -DFFTWF_LIB=/Appl/local/lib/libfftw3f.so \
                       -DFFTWD_THREADS_LIB=/Appl/local/lib/libfftw3_threads.so \
                       -DFFTWF_THREADS_LIB=/Appl/local/lib/libfftw3f_threads.so \
                       -DFFTW_INCLUDE_PATH=/Appl/local/include  \
                       -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/Appl/Focus   .. -L
[root@c 170215]# make && make install

起動

「/Appl/Focus/bin/focus」と入力するとプロジェクト名の入力が求められる。ccp4とかphenixみたい
初回なのでプロジェクトは存在しない。なので、「+Add Project」を選んで、画面下部の「Next」を押下する
2017y02m14d_010352028.png
・・・あとはよく分からぬ....


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Last-modified: 2017-02-15 (水) 06:23:31 (102d)