Gctf
Gautomatch

本家様 http://www.mrc-lmb.cam.ac.uk/kzhang/

ダウンロードは上記サイトから可能。
だが、現時点(170307)ではまだcuda-8.0版がでていなく、別途cuda-7.5とかを準備する必要がある。
っで、環境変数を包んだスクリプトを用意した

[root@c ~]# vi /Appl/local/bin/gautomatch
#!/bin/bash
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-7.5/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
/Appl/Gautomatch/v0.53/Gautomatch-v0.53_sm_20_cu7.5_x86_64 "$@"
 
[root@c ~]#

Gctfも同様に

[root@c ~]# vi /Appl/local/bin/gctf
#!/bin/bash
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-7.5/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
/Appl/Gctf/bin/Gctf-v0.50_sm_30_cu7.5_x86_64 "$@"
 
[root@c ~]#

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Last-modified: 2017-03-07 (火) 00:56:40 (143d)