chaperone

御アクセス頂き誠にありがとうございます。

当サイトは個人の備忘録として存在しております。

そのため、内容は極めて個人的な域をでず、故、内容には一切の責任を持てない事を重々ご了承のほど願います。

然るに、其の採用・参考は自己責任にてお願い申し上げます。内容が古い、間違っている、読みにくい、

誤字脱字、不明瞭、意味不明、駄文とのご感想の際には謹んで深くお詫び申し上げます。

国語の学が弱い若輩故、文書きに長けておりませぬ故、深く恐縮申し上げます。

気が向くままに描いた記事たち。小さく隅に置かれる記事でございますが、いつかは完成させたく存じます。

問い合わせ先：info_at_sysosa.jp *_at_を＠にして下さい

• R5(2023).3.19
  逃避なのか...「Intel oneAPI DPC++/C++ Compiler」(icx/icpx)でrelionをコンパイルしてみた. 完成.
  icc/icpcはEOLのようで今後はこのicx/icpxがメインの様子. intel様のドキュメントを読むといい数値を出している.
  作れた動いたはできるけど、使えるの判定ができないのが限界ですなぁ〜. いつかはしてみたいけど..
• R5(2023).3.17
  書類作成に追われている..
• R5(2023).3.13
  「Buffalo」様の「WI-U3-1200AX2/N」を購入. 別に11ax(1201/573),11ac(833)なwifi母機は持ってない. あるのは11n(300)である.
  これをlinuxに刺して使えるかなと検証. っと言ってもESXiで試してみた. デフォじゃダメでドライバーのインストが必須.
  やっぱりwifi子機は古いのが便利かなぁ..まぁー遅いけど.
• R5(2023).3.11
  合掌
• R5(2023).3.9
  GROMACS 2023のコンパイルにcmake 3.18.4以上が必要みたい... centos7はepelの3.17.5が最大. 詰まった.
  コンパイラならdevtoolsetでGCC-11も可能なのだが cmake は入ってない. ソースから組み込むか..
• R5(2023).3.7
  RoseTTAFold. tensorflow-gpu 1.14.0を使うご様子で30x0なampareでは無理っぽい. nvidia-tensorflowを使うとかかな.
  調子が悪いが確定申告を作らねば...きっつぃ...
• R5(2023).3.6
  土日に20台近くの調整(アプリ, firewall, openPBS)で疲れ果てた..
• R5(2023).3.1
  cryoSPARCが4.2.0に. cuda11.8対応でRTX40x0が利用可能に. でもcuda12.0はまだなのかな... relionは既にcuda12.0に対応済みだけど.
  $HOMEが/home以外の場合のSELinuxの有効方法が分からん...断念. SELinux無効へ...っがRHEL9系はもっとSELinux前提だから悩む..
• R5(2023).2.28
  毎年年度末は多忙になるみたい. 4月になったらゆっくりと仕事したいなぁ...書き直したい記事もあるし.
• R5(2023).2.26
  unisonを試してみた. オリジナルファイルのtimestampを無視していいなら便利. 2つのフォルダ間の同期を重視するなら
  「rsync -r --times /A/ /B/; rsync -r --times /B/ /A/」で済ます方がいいかも.
• R5(2023).2.25
  キーボードはお茶が好きなようでよくかぶっている. ONUはお水がお好きだった模様.
  アプリ関係の記事を更新したいが...難しい
• R5(2023).2.24
  crYOLOが更新されてnapari-boxmanagerなる新しいboxmanagerが追加された. 画面はあー模したのかな？って感じ
• R5(2023).2.22
  不甲斐なく路面で転んでしまった...腰痛追加...
• R5(2023).2.19
  自宅のネット環境が使えなくなった...光回線の終端装置ONUが動かない...
• R5(2023).2.18
  だいぶ回復. 来週は二泊三日の都外出頭. 未達な仕事を逐次対処.
  Guacamoleはvnc/rdpがブラウザ内で使える. けどWireGuardはvpn. ネイティブで使える.
  二段階認証とかセキュアを終始するなら前者. より汎用性、smbとか使うなら後者なのかな.
• R5(2023).2.16
  ちょいと体調不良. お薬頂いて回復を期待. なので内勤のみ
• R5(2023).2.7
  WireGuardを試している. カーネルモジュールに組み込められるほどのモノ. そして確かに早いね.
  二段階認証とかを求めるならGuacamoleなのだろうが、WireGuardはコンパクトで設定が楽. sendmailに対するPostfixじゃないけどかなりコンパクト
• R5(2023).2.4
  alphafold 2.3.1のSingularity版を用意してみた. オプションフラグが追加された模様. 複数マシンを使うことを前提にしてるから
  dockerではなくsingularityを主に扱ってます.
  ubuntuで environment-modules_5.2.0 を入れてみた. EnvironmentModules/package
• R5(2023).1.31
  「'abrt-cli status' timed out」と常に表示される場合は「$HOME/.cache/abrt/lastnotification」の所有権を要確認
• R5(2023).1.29
  各自のホームディレクトリの使用量制限にquotaかなと思って調べてみた. っがsoft limitを超えてもメッセージとか通告とかがない.
  これでは知らず知らずにhard limitまで来てしまってservice out. これでは微妙...shell scriptでターミナルを開くと掲示とかが必要かなぁ..
• R5(2023).1.27
  ヵ課題が多い... cryoSPARCが動かない事例が発生. どうもport_rtp_webappが使うportが他のユーザさんのcryoSPARCで使われていた.
  base portは互いに20以上離れているのだが... nodejsのnodeプロセスが使用するportを固定できればいいのだが..
• R5(2023).1.26
  例のハンドブックがamazon様で購入できるみたい.
• R5(2023).1.25
  cryoSPARCからqsubでジョブを流したが、qsub側のトラブルでそのjobが消えてしまうと適切な応答ができなくて
  ずっとcryoSPARCからqsub側に「このジョブどうなった？」と問い合わせし続ける..
  っで解消するために「cryosparcm cli "set_job_status('P2','J30','killed')"」を実行するみたい
• R5(2023).1.24
  cryoSPARCが 4.1.2 にupdate. ちょくちょくupdateされますね. 機能が増えて喜ばしいです.
  cryoSPARCを利用されるならchmodでもいいけど、setfaclとかを駆使した方がいいかもと思う.
• R5(2023).1.23
  wget,curl,git,conda,pip,yum/dnf,aptらのproxy設定ってOS側の設定を参照してほしいなぁ...
  cryoSPARCのproxy設定はno_prpxyが大事だった...以前記事を書いたのにネットを巡ってしまった...
• R5(2023).1.19
  awsのドキュメント作成. 双方向lsyncってFWの中にある計算機では無理でね？ってことでunisonで同期を提案中.
  あとは計算し終わったノードの自動shutdownかな. 簡単には実行ジョブの末尾にshutdownシーケンスを載せるとかかな.
• R5(2023).1.17
  VeraCrypt 20TBのHDDをVeraCryptで使えるようにするには、、恐らく相当なフォーマット時間を要するかな.
  っがこれは初回だけで、その後は普通のコピーと変わらない気がする.
• R5(2023).1.16
  USB-HDD/SSDを丸ごと暗号化するVeraCryptの記事を作成中. これってSSDの書き込み回数とか考慮するとUSB-HDDの方がいいのかな？
  共通鍵方式で運用できるのでまぁー楽かな.
• R5(2023).1.9
  腰を痛めた. 歩行が妙に遅い. 原因は不明. 寝返りするときも痛む. 参っているが週明けから長期出張. こなさねば.
  FreeIPA、openLDAPの代替に非常にいいのだが、smbとの連携がどうしてもうまくいかない.
  aws案件が未達. 難しい...
• R5(2023).1.3
  dnsmasqを2.79から2.88にupdateしてみた. 既存のdnsmasq.conf、dnsmasq.leases、実行アカウントらの
  変更はさたくないのでbinaryのみ差し替えた. コンパイルしてみたがdnsmasqはほんと軽量ってわかる.
• R5(2023).1.2
  nisがRHEL9から消えたのでFreeIPAを勉強中. そうしたらdnsmasqにURIレコードの登録が必要と言われた.
  dns-rrとして登録が必要なのだが、dnamasqのバージョンが古いと値をhexする必要がある.
  最新版なら「caa-record」に平文で登録できる
• R5(2023).1.1
  謹賀新年
• R4(2022).12.26
  slurmを更新してみた. gpuノードは「persistence mode」の有効化が必須みたい.
  あとmpirunに渡すhostfileを調査中.