昔amberを使って自由エネルギー計算を行った事があった。
っで、現在AmberToolという名でAmberの一部がGPLで使えるそうな。平たく言えば無料で使える。驚いた。
PMEは使えないけどMDは行える。完全版は学位授与機関、非営利、政府系なら500ドル、営利企業なら20,000ドルの対価みたい。
まあーAmberToolでいいや。

入手

Amberのサイトで入手。一応氏名・所属・どこの方らが聞かれる。
ダウンロードサイズが、、、230 MBほど。

コンパイル

展開場所をamberのホームとしてます。

[root@c ~]# cd /opt
[root@c opt]# bzip2 -cd src/AmberTools15.tar.bz2 | tar xf -
[root@c opt]# cd amber14/
[root@c amber14]# export AMBERHOME=/opt/amber14
[root@c amber14]# LANG=C ./configure -noX11 gnu
 
[root@c amber14]# make install

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Last-modified: 2015-06-16 (火) 23:52:25 (827d)