本家様 https://wiki.dynamo.biozentrum.unibas.ch/w/index.php/Main_Page

アプリ取得

https://wiki.dynamo.biozentrum.unibas.ch/w/index.php/DownloadsからLinux向けのtarファイルを取得します。

ファイル名: dynamo-v-1.1.478_MCR-9.6.0_GLNXA64_withMCR.tar (4.9GB)

インストール

[root@em ~]# mkdir -p /apps/Dynamo/
[root@em ~]# cd /apps/Dynamo
[root@em Dynamo]# tar xvf ../src/dynamo-v-1.1.478_MCR-9.6.0_GLNXA64_withMCR.tar
 
[root@em Dynamo]# ls -CF
C/                                     dynamo_setup_linux.sh*
cuda/                                  examples/
ddemos/                                licenses/
doc/                                   matlab/
dynamo_activate_linux.sh*              MCRLinux/
dynamo_activate_linux_shipped_MCR.sh*  mex/
dynamo_activate.m*                     mpi/
dynamo_compile_mpi.sh*                 README_dynamo_installation.txt*
dynamo_setup_cluster.sh*
 
[root@em Dynamo]#

起動

[illya@em ~]$ source /apps/Dynamo/dynamo_activate_linux_shipped_MCR.sh
 
[illya@em ~]$ dynamo
 :
 :
Dynamo > 
Dynamo > dcm

すると下記画面が立ち上がる.
2020y05m20d_220716590.png

あるいは

[illya@em ~]$ source /apps/Dynamo/dynamo_activate_linux_shipped_MCR.sh
 
[illya@em ~]$ dynamo x

これで下記画面が表示されます.

2020y05m20d_220531540.png

modulefiles

「source /apps/Dynamo/dynamo_activate_linux_shipped_MCR.sh」が面倒なのでmodulefilesを作ってみた

[illya@em ~]$ cat /etc/modulefiles/Dynamo
#%Module1.0
 
set dynamo /apps/Dynamo
 
setenv       DYNAMO_FOLDER        $dynamo
 
prepend-path LD_LIBRARY_PATH      $dynamo/MCRLinux/runtime/glnxa64:$dynamo/MCRLinux/bin/glnxa64:$dynamo/MCRLinux/sys/os/glnxa64
 
prepend-path PATH                 $dynamo/matlab/bin:$dynamo/matlab/src:$dynamo/cuda/bin:$dynamo/mpi:$dynamo/examples:$dynamo/doc
 
[illya@em ~]$

上記をロードすれば(module load Dynamo)、「source /apps/Dynamo/dynamo_activate_linux_shipped_MCR.sh」の代わりになります.


トップ   編集 添付 複製 名前変更     ヘルプ   最終更新のRSS
Last-modified: 2020-05-20 (水) 22:11:29 (9d)