MyChemを使ってMySQLで化合物管理用のデータベースを作成します。
データベース名はchemdbとして、
化合物情報を収めるテーブルmolsを用意します。
まずはデータベースを作成。
文字コードはUTF8で、ci:case-insensitiveで大文字小文字や半角全角を区別するデータベースchemdbとする。
[root@s ~]# mysql
mysql> CREATE DATABASE IF NOT EXISTS chemdb CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci
Query OK, 1 row affected (0.00 sec)
mysql> show databases LIKE 'chemdb';
+-------------------+
| Database (chemdb) |
+-------------------+
| chemdb |
+-------------------+
1 row in set (0.00 sec)
mysql>
次にテーブルを作成する。作成するテーブルmolsは、SMILESを扱うので大文字小文字の区別は必須、なのでテーブル作成時にテーブル全体、もしくはフィールドにCOLLATE utf8_binを設ける必要がある。
| mysql> use chemdb;
Database changed
mysql>
mysql> CREATE TABLE IF NOT EXISTS mols (
id int(11) unsigned NOT NULL,
sdf text NOT NULL,
smiles text,
PRIMARY KEY pk_id (id)
)
ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET= utf8 COLLATE= utf8_bin
COMMENT='Compound 3D Structures';
mysql>
mysql> desc mols;
+| Field | Type | Null | Key | Default | Extra |
+| id | int(11) unsigned | NO | PRI | NULL | |
| sdf | text | NO | | NULL | |
| smiles | text | YES | | NULL | |
+3 rows in set (0.00 sec)
mysql>
|
注意：int(11) UNSIGNED はintの整数部分のみを意味します
![[PukiWiki]](image/picc.png "[PukiWiki]")
