RStudio

CentOS7のepelリポジトリで提供している「R」は「R-3.6.0」である.

っで最新の「R-4.x」を使うためには....

  • CentOS8に乗り換える
  • CentOS7のまま使いたい
    • Springdale Computationalリポジトリ提供のR-4.0.2をインストール
    • docker/Singularityで用意する
    • R-4.xをコンパイルする

とかでしょうか.

ここでは「R-4.x」のソースコードを取得してコンパイルして、それを RStudio に繋げたいと思う

R-4.xをコンパイルする

R本家https://www.r-project.org/

事前に下記のパッケージが必要みたい. root権限で操作が必要です.

[root@centos7~]# yum groupinstall "Development Tools" "Java Platform"
[root@centos7~]# yum install epel-release
[root@centos7~]# yum install readline-devel libXt-devel zlib-devel liblzma-devel xz-devel pcre2-devel libcurl-devel bzip2-devel
[root@centos7~]# yum install java-1.7.0-openjdk-devel texlive-latex texlive-latex-bin texinfo texlive-collection-fontsrecommended \
                 texlive-collection-latexrecommended.noarch texinfo-tex

これでコンパイルする環境が整いました.

mkdir $HOME/src
cd src
wget https://cran.r-project.org/src/base/R-4/R-4.0.3.tar.gz
tar xf R-4.0.3.tar.gz
cd R-4.0.3
./configure --prefix=/apps/R-4.0.3 --enable-R-shlib
 
(ホームディレクトリに置くなら)
./configure --prefix=$HOME/apps/R-4.0.3 --enable-R-shlib
 
make
make check
 
make install

次にPATHの設定. 基本[./configure]で「/apps/R-4.0.3/bin/R」あるいは「$HOME/apps/R-4.0.3/bin/R」ファイルの
調整は済んでいるので「$HOME/.bashrc」の修正位かなと

(/apps/R-4.0.3へインストールなら)
export PATH=/apps/R-4.0.3/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/apps/R-4.0.3/lib64
 
($HOMEへインストールなら)
export PATH=$HOME/apps/R-4.0.3/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$HOME/apps/R-4.0.3/lib64

RStudio

っで、RStudio#abed6809と同じようにRStudioを配置する

まずインストールファイルを取得する.
https://rstudio.com/products/rstudio/download/にて
「Zip/Tarballs」の「rstudio-1.3.1093-x86_64-fedora.tar.gz」を取得します. これをホームディレクトリに配置します

(/appsへインストールなら)
[root@centos7 ~]# cd /apps/
[root@centos7 apps]# tar xzf /tmp/rstudio-1.3.1093-x86_64-fedora.tar.gz
 
($HOMEへインストールなら)
[saber@centos7 ~]$ cd $HOME/apps
[saber@centos7 apps]$ tar xzf /tmp/rstudio-1.3.1093-x86_64-fedora.tar.gz

起動は「$HOME/.bashrc」にさらに下記を追加する

(/appsへインストールなら)
export PATH=/apps/rstudio-1.3.1093/bin:$PATH
 
($HOMEへインストールなら)
export PATH=$HOME/apps/rstudio-1.3.1093/bin:$PATH

っで「rstudio」で起動します


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Last-modified: 2020-10-24 (土) 23:31:36 (37d)