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RockyLinux9.1がリリースされた(NOVEMBER 26, 2022)
[root@rockylinux9 ~]# grubby --info=ALL
[root@rockylinux9 ~]# grubby --set-default-index=1
[root@rockylinux9 ~]# grubby --default-kernel
[root@rockylinux9 ~]# reboot外さなくてもいいと思うが、どうしても外したい場合は カーネルパラメータ で指定します. 「/etc/selinux/config」は弄らない.
[root@rockylinux9 ~]# grubby --update-kernel ALL --args selinux=0
[root@rockylinux9 ~]# grub2-mkconfig -o /boot/efi/EFI/rocky/grub.cfg <--- UEFIなら
[root@rockylinux9 ~]# grub2-mkconfig -o /boot/grub2/grub.cfg <-- BIOSなら
[root@rockylinux9 ~]# reboot「/etc/defaults/grub」を修正してgrub2-mkconfigで更新してましたが、grubbyがいいかも
あまり意味はないけど
[root@rockylinux9 ~]# grubby --update-kernel ALL --args ipv6.disable=1
[root@rockylinux9 ~]# grub2-mkconfig -o /boot/efi/EFI/rocky/grub.cfg <--- UEFIなら
[root@rockylinux9 ~]# grub2-mkconfig -o /boot/grub2/grub.cfg <-- BIOSなら
[root@rockylinux9 ~]# rebootudevのルールを弄る. もしくは簡単には「/etc/systemd/network/」を掘ってそこに拡張子linkのファイルを置く.
中身はこんな感じ
[root@rockylinux9 ~]# cat /etc/systemd/network/10-eth0-internal.link
[Match]
MACAddress=bc:24:11:4c:c9:16
[Link]
Name=eth0
[root@rockylinux9 ~]#eth1も用意するなら「/etc/systemd/network/11-eth1-internal.link」とかで同じようにファイルを作る.
再起動で反映されますが、今までのデバイス名とは違うので ip が定義されるように再調整が必要です
rockylinux9のデフォGCCは11.5。これをdevtoolsetでより上のversionに上げれます
dnf install gcc-toolset-14
source scl_source enable gcc-toolset-14みかんせい
開発環境が入っていて、今動いているkernelのkernel-develが入っている事.
簡単には下記を実施
dnf groupinstall "Development Tools"
dnf install kernel-devel
dnf update
rebootこれで最低限の準備は出来るかなと.
っでまずはnouveauを外す
[root@rockylinux9 ~]# grubby --update-kernel ALL --args "nouveau.modeset=0 modprobe.blacklist=nouveau"
[root@rockylinux9 ~]# grub2-mkconfig -o /boot/efi/EFI/rocky/grub.cfg <--- UEFIなら
[root@rockylinux9 ~]# grub2-mkconfig -o /boot/grub2/grub.cfg <-- BIOSなら
[root@rockylinux9 ~]# reboot次に nvidia-driver を入れる.
1. https://www.nvidia.com/ja-jp/drivers/
から使っているGPUカードのドライバーを入手するか
2. nvidia driverのリポジトリを入れてインストール
の２つの方法でしょうか
1.はnvidiaからドライバーを入手して
[root@rockylinux9 ~]# bash /Public/cuda/NVIDIA-Linux-x86_64-570.144.run -Z後は再起動で完了
2.は、https://docs.nvidia.com/datacenter/tesla/driver-installation-guide/index.html#red-hat-enterprise-linux に従って環境整備します
「kernel-devel-matched」と「kernel-headers」が必要そうで、目下の状態を確認します
[root@rockylinux9 ~]# dnf list installed |grep kernel
kernel.x86_64 5.14.0-503.14.1.el9_5 @anaconda
kernel-core.x86_64 5.14.0-503.14.1.el9_5 @anaconda
kernel-devel.x86_64 5.14.0-503.14.1.el9_5 @AppStream
kernel-headers.x86_64 5.14.0-503.14.1.el9_5 @AppStream
kernel-modules.x86_64 5.14.0-503.14.1.el9_5 @anaconda
kernel-modules-core.x86_64 5.14.0-503.14.1.el9_5 @anaconda
kernel-srpm-macros.noarch 1.0-13.el9 @AppStream
kernel-tools.x86_64 5.14.0-503.14.1.el9_5 @anaconda
kernel-tools-libs.x86_64 5.14.0-503.14.1.el9_5 @anaconda
[root@rockylinux9 ~]#っと「kernel-headers」はありますが、「kernel-devel-matched」がない。ここで「dnf install kernel-devel-matched」としてしまうと最新版がインストールされてしまうので現状の「uname -r」に合った「kernel-devel-matched」を
「https://dl.rockylinux.org/vault/rocky」から取得して入れます
[root@rockylinux9 ~]# dnf install https://dl.rockylinux.org/vault/rocky/9.5/AppStream/x86_64/os/Packages/k/kernel-devel-matched-5.14.0-503.14.1.el9_5.x86_64.rpm
[root@rockylinux9 ~]# dnf list installed |grep kernel
:
kernel-devel.x86_64 5.14.0-503.14.1.el9_5 @AppStream
kernel-devel-matched.x86_64 5.14.0-503.14.1.el9_5 @@commandline
kernel-headers.x86_64 5.14.0-503.14.1.el9_5 @AppStream
:
[root@rockylinux9 ~]#と揃えました. 次にepelとnvidiaのリポジトリを登録します。
[root@rockylinux9 ~]# dnf install epel-release
[root@rockylinux9 ~]# dnf config-manager --add-repo https://developer.download.nvidia.com/compute/cuda/repos/rhel9/x86_64/cuda-rhel9.repo
[root@rockylinux9 ~]# cat /etc/yum.repos.d/cuda-rhel9.repo
[cuda-rhel9-x86_64]
name=cuda-rhel9-x86_64
baseurl=https://developer.download.nvidia.com/compute/cuda/repos/rhel9/x86_64
enabled=1
gpgcheck=1
gpgkey=https://developer.download.nvidia.com/compute/cuda/repos/rhel9/x86_64/D42D0685.pub
[root@rockylinux9 ~]#
}}
[cuda-rhel9-x86_64]リポジトリの中身は「dnf list available --disablerepo=* --enablerepo=cuda-rhel9-x86_64」で確認できます. cuda-11-7からcuda-12-9のcudaライブラリが入れられそう
[root@rockylinux9 ~]# dnf module listにてインストール可能なドライバーが表示されます。openと書かれているのはオープンソース版、無印がプロプライエタリー版. 確証はないけどdkms版はオープンソース版かなと. コンパイルできるので
っでここでは オープンソース版 を入れてみます
[root@rockylinux9 ~]# dnf install nvidia-driver-cuda <-- nvidia謹製のopenglが入らないです. GPU計算のみしたいならこちら
[root@rockylinux9 ~]# dnf module install nvidia-driver:latest-dkms <-- nvidia謹製のopenglが入ります. 繋がったモニターの描画が早くなるかもdnf module install nvidia-driver:latest-dkms
CUDA-11.4はRHEL8系まで対応で、RHEL9系に対応するCUDAは 11.7.1 からリリースされている.
なので未対応ながら CUDA-11.4 を適用するしかない. rpmではなく「cuda_11.4.4_470.82.01_linux.run」にて実施
あと
[root@s ~]# vi /etc/profile.d/cuda.sh
export PATH=/usr/local/cuda/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
[root@s ~]# vi /etc/profile.d/cuda.csh
setenv PATH /usr/local/cuda/bin:${PATH}
setenv LD_LIBRARY_PATH /usr/local/cuda/lib64:${LD_LIBRARY_PATH}
[root@s ~]#従来型に戻すにはPermitRootLoginを「yes」にしてsshdを再起動
40c40
< #PermitRootLogin prohibit-password
---
> PermitRootLogin yes各領域は下記のようにしていて、swapは目的により819MB(8GB)とかにしている. それ以上必要な場合はファイルを拵えてswaponしてます
ほぼほぼ最小構成でOSを作って、必要なものを追加インストールしている
追加物
dnf install pciutuls nfs-utils epel-release yum-utils
dnf groupinstall "Development Tools"
dnf install dkmsrelion
dnf groupinstall "Development Tools"
dnf install cmake openmpi-devel libX11-devel fftw-devel libtiff-devel texlive-latex-bin texlive-cm texlive-dvips ghostscript evince python3-tkinter
dnf --enablerepo=devel install fltk-fluid
mkdir -p /apps/src && cd /apps/src
git clone https://github.com/3dem/relion
cd relion
git checkout ver4.0 && mkdir v40 && cd v40
module load mpi/openmpi-x86_64
cmake .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/apps/relion-4.0.0 -DCUDA_TOOLKIT_ROOT_DIR=/usr/local/cuda-11.4 -DCUDA_ARCH=35
make && make installっがエラー. CUDAのライブラリとGCCが合わない模様. RockyLinux9のGCCは11.3.1、CUDA11.4の許容GCCは11まで.
httpdとの連携は php-fpm で行います. 従来のmod_phpが未サポートへ
REHL7まではethXと割り振られていたが以降は別名称になっている.
[root@gate ~]# ip link show
1: lo: <LOOPBACK,UP,LOWER_UP> mtu 65536 qdisc noqueue state UNKNOWN mode DEFAULT group default qlen 1000
link/loopback 00:00:00:00:00:00 brd 00:00:00:00:00:00
2: ens192: <BROADCAST,MULTICAST,UP,LOWER_UP> mtu 1500 qdisc fq_codel state UP mode DEFAULT group default qlen 1000
link/ether 00:0c:29:70:ef:c7 brd ff:ff:ff:ff:ff:ff
altname enp11s0
3: ens224: <BROADCAST,MULTICAST,UP,LOWER_UP> mtu 1500 qdisc fq_codel state UP mode DEFAULT group default qlen 1000
link/ether 00:0c:29:70:ef:d1 brd ff:ff:ff:ff:ff:ff
altname enp19s0
[root@gate ~]#どうしてもってなら「/etc/default/grub」の「GRUB_CMDLINE_LINUX」に「net.ifnames=0 biosdevname=0」を追記ってあるが、まぁこれは非推奨
[root@gate ~]# cat /etc/default/grub
GRUB_TIMEOUT=5
GRUB_DISTRIBUTOR="$(sed 's, release .*$,,g' /etc/system-release)"
GRUB_DEFAULT=saved
GRUB_DISABLE_SUBMENU=true
GRUB_TERMINAL_OUTPUT="console"
GRUB_CMDLINE_LINUX="net.ifnames=0 biosdevname=0"
GRUB_DISABLE_RECOVERY="true"
GRUB_ENABLE_BLSCFG=true
[root@gate ~]# grub2-mkconfig -o /boot/efi/EFI/rocky/grub.cfg
[root@gate ~]# reboot
[root@gate ~]# ip link show
1: lo: <LOOPBACK,UP,LOWER_UP> mtu 65536 qdisc noqueue state UNKNOWN mode DEFAULT group default qlen 1000
link/loopback 00:00:00:00:00:00 brd 00:00:00:00:00:00
2: eth0: <BROADCAST,MULTICAST,UP,LOWER_UP> mtu 1500 qdisc fq_codel state UP mode DEFAULT group default qlen 1000
link/ether 00:0c:29:70:ef:c7 brd ff:ff:ff:ff:ff:ff
altname enp11s0
altname ens192
3: eth1: <BROADCAST,MULTICAST,UP,LOWER_UP> mtu 1500 qdisc fq_codel state UP mode DEFAULT group default qlen 1000
link/ether 00:0c:29:70:ef:d1 brd ff:ff:ff:ff:ff:ff
altname enp19s0
altname ens224
[root@gate ~]#っで非推奨な方法を使わずにethXを作ってみる.
参照先:https://access.redhat.com/documentation/ja-jp/red_hat_enterprise_linux/8/html-single/configuring_and_managing_networking/index#configuring-user-defined-network-interface-names-by-using-udev-rules_consistent-network-interface-device-naming
[root@gate ~]# cat /sys/class/net/ens192/type
1
[root@gate ~]# cat /sys/class/net/ens224/type
1
[root@gate ~]# vi /etc/udev/rules.d/70-persistent-net.rules
SUBSYSTEM=="net",ACTION=="add",ATTR{address}=="00:0c:29:70:ef:c7",ATTR{type}=="1",NAME="eth0"
SUBSYSTEM=="net",ACTION=="add",ATTR{address}=="00:0c:29:70:ef:d1",ATTR{type}=="1",NAME="eth1"
[root@gate ~]# dracut -f
[root@gate ~]# reboot
[root@gate ~]# ip link show
1: lo: <LOOPBACK,UP,LOWER_UP> mtu 65536 qdisc noqueue state UNKNOWN mode DEFAULT group default qlen 1000
link/loopback 00:00:00:00:00:00 brd 00:00:00:00:00:00
2: eth0: <BROADCAST,MULTICAST,UP,LOWER_UP> mtu 1500 qdisc fq_codel state UP mode DEFAULT group default qlen 1000
link/ether 00:0c:29:70:ef:c7 brd ff:ff:ff:ff:ff:ff
altname enp11s0
3: eth1: <BROADCAST,MULTICAST,UP,LOWER_UP> mtu 1500 qdisc fq_codel state UP mode DEFAULT group default qlen 1000
link/ether 00:0c:29:70:ef:d1 brd ff:ff:ff:ff:ff:ff
altname enp19s0
[root@gate ~]#っな感じでethXが使えます. これはMACアドレスでeth0とeth1を定義してますので別のnicカードを追加しても不変かな.
そもそもnic名称がens(pciのスロットインデックス由来)やenp(ハードウエアのコネクタの物理的な場所由来)、eno(オンボードでのインデックス番号由来)によらず
macアドレスベースの名称も適用できるようで
参照先:https://access.redhat.com/documentation/ja-jp/red_hat_enterprise_linux/8/html-single/configuring_and_managing_networking/index#network-interface-naming-policies_consistent-network-interface-device-naming
[root@gate ~]# vi /usr/lib/systemd/network/99-default.link
NamePolicy=keep kernel database onboard slot path
↓
NamePolicy=mac
[root@gate ~]# reboot
[root@gate ~]# ip link show
1: lo: <LOOPBACK,UP,LOWER_UP> mtu 65536 qdisc noqueue state UNKNOWN mode DEFAULT group default qlen 1000
link/loopback 00:00:00:00:00:00 brd 00:00:00:00:00:00
2: enx000c2970efc7: <BROADCAST,MULTICAST,UP,LOWER_UP> mtu 1500 qdisc fq_codel state UP mode DEFAULT group default qlen 1000
link/ether 00:0c:29:70:ef:c7 brd ff:ff:ff:ff:ff:ff
altname enp11s0
altname ens192
3: enx000c2970efd1: <BROADCAST,MULTICAST,UP,LOWER_UP> mtu 1500 qdisc fq_codel state UP mode DEFAULT group default qlen 1000
link/ether 00:0c:29:70:ef:d1 brd ff:ff:ff:ff:ff:ff
altname enp19s0
altname ens224
[root@gate ~]#とnicの名称が mac ベースとなる.
