![[PukiWiki]](image/picc.png "[PukiWiki]")
#author("2025-09-19T20:48:30+00:00","default:sysosa","sysosa") #author("2025-09-19T20:49:59+00:00","default:sysosa","sysosa") DIALS (Diffraction Integration for Advanced Light Sources): 結晶学における回折データの処理ソフトウェア 主に X線回折での大規模データ処理 用途ですが、最近は 電子線回折 対応が進んで MicroED 解析にも使用される 本家様 [[https://dials.github.io/>+https://dials.github.io/]] github [[https://github.com/dials/dials>+https://github.com/dials/dials]] (BSD-3-Clause license) ***インストール [#qa877563] 本家様からパッケージを取得して展開します #code(nonumber){{ [root@rockylinux9 ~]# cd /apps/src [root@rockylinux9 src]# wget https://github.com/dials/dials/releases/download/v3.25.0/dials-v3-25-0-linux-x86_64.tar.xz [root@rockylinux9 src]# tar xf dials-v3-25-0-linux-x86_64.tar.xz && cd dials-installer [root@rockylinux9 dials-installer]# ./install --prefix=/apps --openmp [root@rockylinux9 dials-installer]# cd /apps/dials-v3-25-0/ [root@rockylinux9 dials-v3-25-0]# ls -lh total 20K drwxrwsr-x. 36 root root 4.0K Sep 20 02:42 build drwxr-xr-x. 18 root root 4.0K Sep 20 02:42 conda_base -rw-r--r--. 1 root root 111 Sep 20 02:42 dials_env.csh -rw-r--r--. 1 root root 103 Sep 20 02:42 dials_env.sh -rw-r--r--. 1 root root 1.6K Sep 20 02:43 LICENSE drwxrwsr-x. 13 root root 188 Sep 20 02:42 modules [root@rockylinux9 dials-v3-25-0]# }} あとdui2を淹れます. 「dui」(dui version1)の開発は終了のようで、現在その進化版の dui2 が提供されている. githubは [[https://github.com/ccp4/DUI2>+https://github.com/ccp4/DUI2]] これを /apps に展開します #code(nonumber){{ [root@rockylinux9 ~]# cd /apps [root@rockylinux9 apps]# git clone https://github.com/ccp4/DUI2 [root@rockylinux9 apps]# source /apps/dials-v3-25-0/dials_env.sh [root@rockylinux9 apps]# which dials.python /apps/dials-v3-25-0/build/bin/dials.python [root@rockylinux9 apps]# dials.python -V Python 3.13.5 [root@rockylinux9 apps]# dials.python -m pip install pyside6 [root@rockylinux9 apps]# dnf install xcb-util-cursor xcb-util-image xcb-util-keysyms xcb-util-wm }} 以上でインストールは完了 ***Environment-modules [#jba0a7e6] 「/apps/modulefiles/dials/3.25.0」 #code(nonumber){{ #%Module set dials /apps/dials-v3-25-0 setenv DIALS $dials setenv DIALS_VERSION v3-25-0 prepend-path PATH $dials/build/bin:$dials/conda_base/bin set-alias dui2 "/apps/dials-v3-25-0/build/bin/dials.python /apps/DUI2/src/run_dui2.py" }} ***うごかす [#b4c2dfd8] #code(nonumber){{ [saber@rockylinux9 ~]$ module load dials [saber@rockylinux9 ~]$ dui2 }} &ref(2025y09m18d_025954604.png,nolink,70%); ***めも [#q88e3e2a] 「&color(red){ImportError: /apps/pyenv/versions/miniforge3-25.3.1-0/envs/dials_env/bin/../lib/libharfbuzz.so.0: undefined symbol: FT_Get_Colorline_Stop)};」と表示されるのなら 「xcb-util-cursor」を入れる ***dui (dui version 1)を使うには [#o4df6c7a] 最新版の dials では dui が動かなくて、古いversion の dials なら行ける version 3.16.1 なら行ける. version 3.16.1 なら行けた. それより最新版だとエラーで起動しない. #code(nonumber){{ [root@rockylinux9 ~]# cd /apps/src [root@rockylinux9 src]# wget https://github.com/dials/dials/releases/download/v3.16.1/dials-v3-16-1-linux-x86_64.tar.xz [root@rockylinux9 src]# tar xf dials-v3-16-1-linux-x86_64.tar.xz [root@rockylinux9 src]# cd dials-installer [root@rockylinux9 dials-installer]# ./install --prefix=/apps --openmp }} 次に dui version 1を取得します #code(nonumber){{ [root@rockylinux9 ~]# cd /apps [root@rockylinux9 apps]# git clone https://github.com/ccp4/DUI [root@rockylinux9 apps]# cd DUI (dials-v3-16-1を有効にして) [root@rockylinux9 DUI]# source /apps/dials-v3-16-1/dials_env.sh [root@rockylinux9 DUI]# which dials.python /apps/dials-v3-16-1/build/bin/dials.python [root@rockylinux9 DUI]# dials.python -V Python 3.10.12 [root@rockylinux9 DUI]# dials.python -m pip install PySide2 <-- dui 向けに PySide2 をインストール [root@rockylinux9 DUI]# dials.python setup.py install }} Environment-modulesは「/apps/modulefiles/dials/3.16.1」として #code(nonumber){{ #%Module set dials /apps/dials-v3-16-1 setenv DIALS $dials setenv DIALS_VERSION v3-16-1 prepend-path PATH $dials/build/bin:$dials/conda_base/bin set-alias dui /apps/DUI/bin/dui }} 「module load dials/3.16.1」とロードさせて「dui」と実行すると下記のような画面になります &ref(2025y09m18d_041812353.png,nolink,80%);
