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MyChemを使ってMySQLで化合物管理用のデータベースを作成します。

データベース名は&color(magenta){chemdb};として、
化合物情報を収めるテーブル&color(orangered){mols};を用意します。

まずはデータベースを作成。
文字コードはUTF8で、ci:case-insensitiveで大文字小文字や半角全角を区別するデータベース&color(magenta){chemdb};とする。

#code(nonumber){{
[root@s ~]# mysql
mysql> CREATE DATABASE IF NOT EXISTS chemdb CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci
Query OK, 1 row affected (0.00 sec)

mysql> show databases LIKE 'chemdb';
+-------------------+
| Database (chemdb) |
+-------------------+
| chemdb            |
+-------------------+
1 row in set (0.00 sec)

mysql>
}}
次にテーブルを作成する。作成するテーブル&color(orangered){mols};は、SMILESを扱うので大文字小文字の区別は必須、なのでテーブル作成時にテーブル全体、もしくはフィールドにCOLLATE &color(green){''utf8_bin''};を設ける必要がある。

#code(sql,nonumber,nooutline,noblock,noliteral,nocomment,nomenu,noicon,nolink){{
mysql> use chemdb;
Database changed
mysql>
mysql> CREATE TABLE IF NOT EXISTS mols (
   id int(11) unsigned NOT NULL,
   sdf    text NOT NULL,
   smiles text,
   PRIMARY KEY pk_id (id)
   )
   ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET= utf8 COLLATE= utf8_bin
   COMMENT='Compound 3D Structures';
mysql>
mysql> desc mols;
+--------+------------------+------+-----+---------+-------+
| Field  | Type             | Null | Key | Default | Extra |
+--------+------------------+------+-----+---------+-------+
| id     | int(11) unsigned | NO   | PRI | NULL    |       |
| sdf    | text             | NO   |     | NULL    |       |
| smiles | text             | YES  |     | NULL    |       |
+--------+------------------+------+-----+---------+-------+
3 rows in set (0.00 sec)

mysql>
}}
&color(red){注意：int(11) UNSIGNED はintの整数部分のみを意味します};