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#author("2024-10-27T16:53:13+00:00","default:sysosa","sysosa")
Biomolecular simulation trajectory/data analysis.

本家様 [[https://github.com/Amber-MD/cpptraj>+https://github.com/Amber-MD/cpptraj]]

#code(nonumber){{
[root@rockylinux9 ~]# cd /apps/src
[root@rockylinux9 src]# git clone https://github.com/Amber-MD/cpptraj
[root@rockylinux9 src]# cd cpptraj

[root@rockylinux9 cpptraj]# mkdir /apps/cpptraj

[root@rockylinux9 cpptraj]# dnf --enablerepo=devel install openblas-devel


[root@rockylinux9 cpptraj]# module load cuda/11.8

[root@rockylinux9 cpptraj]# module load ambertools/23.6

(1080をお持ちなら sm_61)

[root@rockylinux9 cpptraj]# SHADER_MODEL=sm_61 ./configure --prefix=/apps/cpptraj -openmp -cuda -openblas --with-blas=/usr gnu

[root@rockylinux9 cpptraj]# make
}}