![[PukiWiki]](image/picc.png "[PukiWiki]")
#author("2023-08-28T12:49:08+00:00","default:sysosa","sysosa") #author("2023-10-11T15:48:58+00:00","default:sysosa","sysosa") $HOMEにcryoなるフォルダを用意して #code(nonumber){{ setfacl -m user:cryosparc:rx $HOME setfacl -m user:cryosparc:rx $HOME/cryo setfacl -dm user:cryosparc:rxw $HOME/cryo setfacl -dm user:$USER:rxw $HOME/cryo }} とcryoSPARCサービスの稼働ユーザcryosparcに書き込み権限を与える. そして解析を進めていけばどんどん $HOME のサイズは当然大きくなる. LVMやzfs、btrfs、cephらを駆使しつつ $HOME を単一ボリュームとして大きくできるが、 別のボリュームにも移したい事がある. 例えば /home/$USER から /home2/$USER にとか. ここではそのようなデータ移動について記載します ***同一インスタンス内での移動 [#s96fded4] 参照先 [[https://guide.cryosparc.com/setup-configuration-and-management/software-system-guides/guide-data-management-in-cryosparc-v4.0+#use-case-moving-a-project-directory-from-one-storage-location-to-another>+https://guide.cryosparc.com/setup-configuration-and-management/software-system-guides/guide-data-management-in-cryosparc-v4.0+#use-case-moving-a-project-directory-from-one-storage-location-to-another]] cryoSPARCでは「&color(magenta){project directory};」と称して１つのディレクトリ内に解析結果を置いている. &size(10){その１つの「&color(magenta){project directory};」の中に複数の「&color(orangered){Workspace};」が置かれる}; cryoSPARC 3とかなら「P1」「P2」とかでしょうか. 最近では「CS-<プロジェクト名>」になってきてます. 同一インスタンス内での移動は -対象のプロジェクトをArchiveして -対象のフォルダを別の場所に移動 -cryoSPARCから unArchive を実行 これで別の場所にプロジェクト ディレクトリが移動できます. 注意点としては、移動先のフォルダがcryoSPARCサービスで参照可能で書き込み権限があるかでしょうか. 画面を用いて説明すれば、異動対象のプロジェクトを選択して、右側にある「...」をクリックしてメニューを表示させます. そこで「Archive Project」を選びます &ref(2023y08m28d_031408373.png,nolink); その後、OKを選択して &ref(2023y08m28d_031710119.png,nolink); 最終確認画面に移ります. そこでこのプロジェクトのIDを入力して「Archive」を押下します. これでフォルダがアーカイブモードになりました. &ref(2023y08m28d_031725731.png,nolink); cryoSPARC画面はそのままプロジェクトは残ってますが、「Archived」になってます. &ref(2023y08m28d_032245626.png,nolink); 次に、実際のファイルシステム側での作業となります. 今回は $HOME/cryo から $HOME/cryo2 へ移動を想定します. なので #code(nonumber){{ mkdir $HOME/cryo2 setfacl -m user:cryosparc:rx $HOME/cryo2 setfacl -dm user:cryosparc:rxw $HOME/cryo2 mv $HOME/cryo/CS-rc-sample-run $HOME/cryo2/ }} で移動させます. っで最後にまたcryoSPARC画面にてファイルシステムでデータを移動させても残っているプロジェクトの右側の「...」をクリックして「Unarchive Project」を選びます. &ref(2023y08m28d_032431492.png,nolink); OKかの選択を経て &ref(2023y08m28d_032633676.png,nolink); 移動させたデータの場所を指定します。ここではフォルダ名を指定するだけです。そしてUnarchiveを押下します &ref(2023y08m28d_032809321.png,nolink); これで移動は完了です これは同一のインスタンス. 同じcryoSPARCデータベース内での実ファイルの移動を行う際のお話. 次は、別のインスタンス、他のcryoSPARCサービスへの移動のお話になります ***別のインスタンスへの移動 [#n65e19ec] 参照先 [[https://guide.cryosparc.com/setup-configuration-and-management/software-system-guides/guide-data-management-in-cryosparc-v4.0+#use-case-transfer-a-project-from-one-cryosparc-instance-to-another>+https://guide.cryosparc.com/setup-configuration-and-management/software-system-guides/guide-data-management-in-cryosparc-v4.0+#use-case-transfer-a-project-from-one-cryosparc-instance-to-another]] 別のインスタンスへの移動は -対象のプロジェクトをdetachして -対象のフォルダを別の場所に移動 -cryoSPARCから attach を実行 で行えます。この際数字番号な「P1」「P2」とかの数字は異なるみたい. ***メモ [#td0c605a] 今あるプロジェクトのリスト #code(nonumber){{ cryosparcm cli "list_projects()" | sed "s/'/\"/g" | sed "s/False/false/g" |sed "s/True/true/g" | jq -r |less cryosparcm cli "list_projects()" | sed "s/'/\"/g" | sed "s/False/false/g" |sed "s/True/true/g" | jq -r '.[] | [.uid, .project_dir, .title]|@csv' }} で閲覧可能. 結果はこんな感じかな #code(nonumber){{ "P1","/home/cryosparc/P1","sample" "P2","/home/cryosparc/P2","ABC" }} っでこれをdetachの場合は「cryosparcm cli "detach_project('P1')"」とします。これで「/home/cryosparc/P1」は他のインスタンス、他のマシンのインスタンスに移せます 移した後でのatacheは「attach_project(owner_user_id: str, abs_path_export_project_dir: str)」とある. owner_user_id値は「cryosparcm listusers」で表示されるIDです。英数字の２４文字かな. なので #code(nonumber){{ cryosparcm cli "attach_project('64c2f47e09e87fxxxxxxxxxx', '/cryo/P1') }} とかでしょうか. 以上は detach-attachの場合。 ~ 前段の archive-unarchive は同一マシン内のでフォルダ移動です。「archive_project(project_uid: str)」と「unarchive_project(project_uid: str, abs_path_to_project_dir: str)」なので #code(nonumber){{ cryosparcm cli "archive_project('P1')" <フォルダのcopy> cryosparcm cli "unarchive_project('64c2f47e09e87fyyyyyyyyyy','/data/P1')" }} でしょうか.
