novaSTA の変更点

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#author("2025-03-26T15:18:15+00:00","default:sysosa","sysosa")
#author("2025-03-26T15:19:18+00:00","default:sysosa","sysosa")
本家様 [[https://github.com/turonova/novaSTA>+https://github.com/turonova/novaSTA]]

Subtomogram averaging package based on TOM/AV3


***インストール [#yb0ee154]
#code(nonumber){{
cd /apps/src
git clone https://github.com/turonova/novaSTA
cd novaSTA
module load mpi/openmpi-x86_64
}}
一部makefileを弄る

#code(diff,nonumber){{
--- makefile.orig       2025-03-27 00:11:09.367362833 +0900
+++ makefile    2025-03-27 00:16:46.270548389 +0900
@@ -12,11 +12,11 @@
 CXXFLAGS = -std=c++14 #-std=c++0x

 CUDA = nvcc
-CUDA_INCLUDES = -I"${cudapath}/include"
+CUDA_INCLUDES = -I"/usr/local/cuda-10.2/include" -I"/usr/include/openmpi-x86_64"

 #OBJECTS = $(SOURCES:.cpp=.o)

-LIBRARIES = -lfftw3 -lfftw3f -lpthread -lcudart -lcufft
+LIBRARIES = -lfftw3 -lfftw3f -lpthread -lcudart -lcufft -L/usr/local/cuda-10.2/lib64

 all: ${program}
}}
っで

#code(nonumber){{
make includepath="/usr/local/cuda-10.2/include /usr/include/openmpi-x86_64" -j 20
}}