xray/coot の変更点

• 追加された行はこの色です。
• 削除された行はこの色です。
• xray/coot へ行く。
• xray/coot の差分を削除

#author("2019-09-16T21:30:10+00:00","default:sysosa","sysosa")
#author("2019-10-07T16:13:01+00:00","default:sysosa","sysosa")
***coot [#u149bca6]

電子密度マップを表示させ、モデルを作るには必須なツール。
これもccp4同様windows版がある。cootの三次元描画はOpenGLで組まれているようでwindows, openGL, 立体視なら
nVIDIAさんの３Ｄ　Ｖｉｓｉｏｎ。っで、実際にnVIDIAのカードで試したが成功。
Linuxで立体視を行うには３ピンステレオが必要だが、windowsではusbでIRエミッターと接続可能で
より安価なquadroカードで立体視が可能となる。

***インストール [#h2d0e308]
 # yum install openssl098e.x86_64      *追加パッケージが必要です
 # cd /Appl/Linux
 # gzip -cd coot-0.6.2-binary-Linux-x86_64-centos-5-gtk2.tar.gz | tar xf -
 # ln -s coot-Linux-x86_64-centos-5-gtk2 coot
これでインストールは完了。
実行は PATH環境変数に /Appl/Linux/coot/bin を加えればいいみたい。
 $ export PATH=/Appl/Linux/coot/bin:$PATH
な感じで

[[win版>xray/coot/windows]]



***CentOS7.6では [#p0b0c1dd]
coot-0.8.9.1-binary-Linux-x86_64-scientific-linux-7.4-python-gtk2.tar.gz
を入手して
libgnomecanvas
compat-guile18-devel(epel)
っがエラーが生じる
#code(nonumber){{
*** Cannot find the double-buffered visual.
*** Trying single-buffered visual.
coot-0.8.9.2-pre-revision-7766-binary-Linux-x86_64-rhel-6-python-gtk2.tar.gz
を入手してください。

*** No appropriate OpenGL-capable visual found.
guile: error while loading shared libraries: libltdl.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
failed to launch the crash catcher
}}