cryosparcm cluster example slurm
cluster_info.json内にある「qstat_code_cmd_tpl」のコマンド行が微妙でエラーになります
どうもパイプ(|)がダメらしくて下記に変更します
"qstat_code_cmd_tpl": "squeue -j {{ cluster_job_id } } --format=%T | sed -n 2p",
↓
"qstat_code_cmd_tpl": "squeue --noheader -j {{ cluster_job_id } } --format=%T",
Pukiwikiの表記のため一部表記を変えてます
{
"name" : "node01",
"worker_bin_path" : "/home/cryosparc/cryosparc_worker/bin/cryosparcw",
"cache_path" : "/scratch/cryosparc",
"send_cmd_tpl" : "{{ command } }",
"qsub_cmd_tpl" : "sbatch {{ script_path_abs } }",
"qstat_cmd_tpl" : "squeue -j {{ cluster_job_id } }",
"qstat_code_cmd_tpl": "squeue --noheader -j {{ cluster_job_id } } --format=%T",
"qdel_cmd_tpl" : "scancel {{ cluster_job_id } }",
"qinfo_cmd_tpl" : "sinfo",
"transfer_cmd_tpl" : "cp {{ src_path } } {{ dest_path } }"
}
![[PukiWiki]](image/picc.png "[PukiWiki]")
