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不定期に cryoSPARC のupdate/patch がリリースされます.
その適用法について.
大事.
cryoSPARCを動かしているユーザになって
[root@cryosparc ~]# su - cryosparc
[cryosparc@cryosparc ~]$
[cryosparc@cryosparc ~]$ cryosparcm maintenancemode on <-- 実行中のジョブはそのまま実行されますが、新規ジョブの受付が却下されます
[cryosparc@cryosparc ~]$ cryosparcm cli "set_instance_banner(True, '*** Notice ***', 'We are updating cryoSPARC.')" <--(オプション)webにバナーを出せます
[cryosparc@cryosparc ~]$ cryosparcm jobstatus <-- 実行中のジョブが完了したかを確認して
[cryosparc@cryosparc ~]$ cryosparcm backupバックアップ先は cryosparc_master/config で定義されている「CRYOSPARC_DB_PATH」のフォルダの下に 「backup」フォルダを作ってそこに置かれます
ファイルフォーマットは下記の仕様です
「cryosparc_backup_YYYY_MM_DD_HHhSS.archive」例「cryosparc_backup_2025_10_25_02h31.archive」
データベースサイズが 2TB, 3TB とかになると１日かなぁ..
現在使用しているバージョンと最新リリースのバージョンは「cryosparcm update --check」で調べられます
[cryosparc@cryosparc ~]$ cryosparcm updateこれでその時点での最新版がインストールされます.
たまにversion指定が求めれることがあって、その場合は
[cryosparc@cryosparc ~]$ cryosparcm update --version=v4.7.1と「--version」で指定します. ちなみにこれで以前のバージョンにも戻せます.
適用可能なversionは「cryosparcm update --list」で見れますが、v4.4.0以降のcryoSPARCはv3.4.0までなら戻せる. 使っているMongoDBのversionのため.
運用形態が「スタンドアローン形式」もしくは「Master-Worker形式」なら「Master」に続き「Worker」も同時にupdateされますが、
「Clusters形式」だと「Master」しかupdateされません。
その場合は「cryosparc_master」フォルダのダウンロードされた workerのパッケージを「cryosparc_worker」にコピーして「cyrosparcw update」を実行します
cp cryosparc_master/cryosparc_worker.tar.gz cryosparc_worker/
cd cryosparc_worker/
./bin/cryosparcw update「cryosparcm update --download-only」でupdateファイルのみ取得できます
「cryosparcm update --skip-download」でcryosparc_masterに置いてある「cryosparc_master.tar.gz」「cryosparc_worker.tar.gz」を使ってupdateします
たまにpatchが提供されることがある. v4.7.1で出された 250814 とかである。
当て方は下記のようにします.
[cryosparc@cryosparc ~]$ cryosparcm patchこちらも「スタンドアローン形式」もしくは「Master-Worker形式」なら「Master」「Worker」共にpatchが適用されるが、
「Clusters形式」だと「Master」のみ適用される.
この場合ですが、「cryosparcm patch --download」でパッチファイルのみをダウンロードします. 既に「Master」にpatchが適用されてたら「cryosparcm patch --download --force」を使う
っで取得した 「Master」 のパッチファイルを cryosparc_worker に運んで適用させます
cryosparcm patch --download --force
cryosparcm patch --install
cp cryosparc_master/cryosparc_worker_patch.tar.gz cryosparc_worker/
cd cryosparc_worker
./bin/cryosparcw patch[cryosparc@cryosparc ~]$ cryosparcm maintenancemode off
[cryosparc@cryosparc ~]$ cryosparcm cli "set_instance_banner(False)" <-- (オプション)webにバナーを閉じますっで一連の作業は完了
