ctffind

本家様 http://grigoriefflab.janelia.org/ctf

Linux向けのは提供されているバイナリ―版をそのまま利用された方が宜しいかと。

MacOSXctffind/MacOSX

ctffind-4.1

wxWidgetsが必要。
CentOS 7ではepelリポジトリにあるwxGTK3をインストールします。

[root@c ~]# yum install wxGTK3-devel fftw-devel

*wxGTK3はepelリポジトリで入手可能です

そして、

[root@c ~]# cd /Appl/src/
[root@c src]#
[root@c src]# curl -O http://grigoriefflab.janelia.org/sites/default/files/ctffind-4.1.5.tar.gz
 
[root@c src]# gzip -cd ctffind-4.1.5.tar.gz | tar xf - && cd ctffind-4.1.5
[root@c ctffind-4.1.5]#
[root@c ctffind-4.1.5]# ./configure --prefix=/Appl/ctffind-4.1.5 --with-wx-config=/usr/libexec/wxGTK3/wx-config
[root@c ctffind-4.1.5]#
[root@c ctffind-4.1.5]# make
 :
 :
In file included from src/programs/ctffind/ctffind.cpp:1:0:
src/programs/ctffind/../../core/core_headers.h:59:32: 致命的エラー: refinement_package.h: そのようなファイルやディレクトリはあり ません
 #include "refinement_package.h"
                                ^
コンパイルを停止しました。
make: *** [ctffind-ctffind.o] エラー 1
[root@c ctffind-4.1.5]#

とエラーになる。

なのでソースからは作れないみたい。

[root@c ctffind-4.1.5]# find . -name refinement_package.h

と、そもそもrefinement_package.hがないみたい

なので、4.1.5に関しては、バイナリー版を使うしかないみたい。

[root@c ~]# mkdir /Appl/ctffind-4.1.5
[root@c ~]# cd /Appl/ctffind-4.1.5
[root@c ctffind-4.1.5]#
[root@c ctffind-4.1.5]# curl -O http://grigoriefflab.janelia.org/sites/default/files/ctffind-4.1.5-linux64.tar.gz
[root@c ctffind-4.1.5]# gzip -cd ctffind-4.1.5-linux64.tar.gz | tar xf -
[root@c ctffind-4.1.5]# ls -l ./bin
合計 28424
-rwxr-xr-x 1 root root 29097777  9月 10 00:15 ctffind
-rwxr-xr-x 1 root root     4717  9月 10 00:15 ctffind_plot_results.sh
[root@c ctffind-4.1.5]#

と展開


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Last-modified: 2019-12-05 (木) 21:15:26 (44d)