ccp4でも使われるfasta

CentOS6にて
*コンパイルするので開発環境は必要

[root@c ~]# mkdir -p /Appl/Linux/src; cd /Appl/Linux/src
[root@c src]# wget http://faculty.virginia.edu/wrpearson/fasta/CURRENT/fasta-36.3.6d.tar.gz
[root@c src]# cd ..
[root@c Linux]# gzip  -cd ./src/fasta-36.3.6d.tar.gz | tar xf -
[root@c Linux]#
[root@c Linux]# cd fasta-36.3.6d
[root@c fasta-36.3.6d]# cd src
[root@c src]#
[root@c src]# make -f ../make/Makefile.linux64_sse2 -j3
[root@c src]# ls ../bin
fasta36  fastm36  fastx36  ggsearch36  lalign36  lav2svg  ssearch36  tfastm36  tfastx36
fastf36  fasts36  fasty36  glsearch36  lav2ps    map_db   tfastf36   tfasts36  tfasty36
[root@c src]#
[root@c src]# cd /Appl/Linux
[root@c Linux]# ln -s fasta-36.3.6d fasta
[root@c Linux]#

.bashrcには
export PATH=/Appl/Linux/fasta/bin:$PATH
とかで反映させておく


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Last-modified: 2013-12-01 (日) 16:31:28 (2485d)