本家様 https://launchpad.net/pbzip2

gzipの並列版pigz
xzの並列版pixz

そして bzip2 の並列版が pbzip2 となるみたい.

インストールはRHEL系なら epel リポジトリを加えればインストール可能です

[root@rockylinux ~]# dnf info pbzip2
Last metadata expiration check: 0:00:35 ago on Sat 06 Apr 2024 07:05:55 PM JST.
Available Packages
Name         : pbzip2
Version      : 1.1.13
Release      : 1.el8
Architecture : x86_64
Size         : 57 k
Source       : pbzip2-1.1.13-1.el8.src.rpm
Repository   : epel
Summary      : Parallel implementation of bzip2
URL          : https://launchpad.net/pbzip2
License      : BSD
Description  : PBZIP2 is a parallel implementation of the bzip2 block-sorting file
             : compressor that uses pthreads and achieves near-linear speedup on SMP
             : machines.  The output of this version is fully compatible with bzip2
             : v1.0.2 or newer (ie: anything compressed with pbzip2 can be
             : decompressed with bzip2).
 
[root@rockylinux ~]#
 
[root@rockylinux ~]# dnf install pbzip2

っで使い方

[saber@rockylinux ~]$ pbzip2    -p4 DRR127450.fastq    <-- 4coreで圧縮
 
[saber@rockylinux ~]$ pbzip2 -d -p4 DRR127450.fastq.bz2 <-- 4coreで解凍

こんか感じ

単一の巨大なファイルを圧縮解凍するなら pbzip2pigzpixzを使うのがいいかなと思う。
もし多数のファイル1000枚とか5000枚とかなら parallelでbzip2, gzip, zx を回した方がいいかもね.

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Last-modified: 2024-04-06 (土) 19:33:18