EnvironmentModules/run をテンプレートにして作成
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開始行:
EnvironmentModulesを実際に使用するに当たって、PATH環境変...
ログイン直後のbash/tcsh(csh)のパスは下記となっている(Cent...
#code(nonumber){{
bash
/usr/local/bin:/usr/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin:/home/$...
tcsh(csh)
/usr/local/bin:/usr/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin
}}
仮に Relion-3.0-beta-2 の&color(magenta){modulefile}; が...
#code(nonumber){{
#%Module1.0
prepend-path PATH /Appl/relion-3.0-beta-2/bin
prepend-path PATH /usr/lib64/openmpi/bin
prepend-path LD_LIBRARY_PATH /usr/lib64/openmpi/lib
}}
そして、eman2.22 の&color(magenta){modulefile}; が下記と...
#code(nonumber){{
#%Module1.0
prepend-path PATH /Appl/eman2.22/bin
}}
先に Relion をmoduleコマンドでloadして、それからEMAN2をlo...
#code(nonumber){{
[saber@c ~]$ module load relion/3.0-beta-2
[saber@c ~]$ module load eman2/2.22
[saber@c ~]$ which mpirun
/Appl/eman2.22/bin/mpirun
[saber@c ~]$
}}
全体のPATHから見ると下記になる。
#code(nonumber){{
[saber@c ~]$ echo $PATH
/Appl/eman2.22/bin:/usr/lib64/openmpi/bin:/Appl/relion-3....
[saber@c ~]$
}}
「prepend-path」を使用しているから仕方ないのだが、逆にapp...
この辺は難しい。
単に、アプリ毎にmoduleをloadさせればいいのかな？って思っ...
なら再度relionをロードすれば..と思えるが、既にあるのでloa...
結局は eman2/2.22 をunload させればOKとなる。
終了行:
EnvironmentModulesを実際に使用するに当たって、PATH環境変...
ログイン直後のbash/tcsh(csh)のパスは下記となっている(Cent...
#code(nonumber){{
bash
/usr/local/bin:/usr/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin:/home/$...
tcsh(csh)
/usr/local/bin:/usr/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin
}}
仮に Relion-3.0-beta-2 の&color(magenta){modulefile}; が...
#code(nonumber){{
#%Module1.0
prepend-path PATH /Appl/relion-3.0-beta-2/bin
prepend-path PATH /usr/lib64/openmpi/bin
prepend-path LD_LIBRARY_PATH /usr/lib64/openmpi/lib
}}
そして、eman2.22 の&color(magenta){modulefile}; が下記と...
#code(nonumber){{
#%Module1.0
prepend-path PATH /Appl/eman2.22/bin
}}
先に Relion をmoduleコマンドでloadして、それからEMAN2をlo...
#code(nonumber){{
[saber@c ~]$ module load relion/3.0-beta-2
[saber@c ~]$ module load eman2/2.22
[saber@c ~]$ which mpirun
/Appl/eman2.22/bin/mpirun
[saber@c ~]$
}}
全体のPATHから見ると下記になる。
#code(nonumber){{
[saber@c ~]$ echo $PATH
/Appl/eman2.22/bin:/usr/lib64/openmpi/bin:/Appl/relion-3....
[saber@c ~]$
}}
「prepend-path」を使用しているから仕方ないのだが、逆にapp...
この辺は難しい。
単に、アプリ毎にmoduleをloadさせればいいのかな？って思っ...
なら再度relionをロードすれば..と思えるが、既にあるのでloa...
結局は eman2/2.22 をunload させればOKとなる。
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