OpenPBS/environment をテンプレートにして作成
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開始行:
pbsproを実行した際、環境変数はどうなるの？
ジョブサブミッションサイトでの環境変数をそのまま引き継げ...
「#PBS -V」を追加すれば、環境変数は引き継げられるが、計算...
もし~/.bashrcにて PATH=ABC:$PATH があれば、計算ノードでは...
「#PBS -V」を追加しないのなら、計算ノードでの環境変数は、...
qsubの中で特定の環境変数を使いたいのなら、qsub.shにその内...
#code(nonumber){{
#!/bin/bash
#PBS -q g3
#PBS -l nodes=g03:ppn=1
#PBS -j oe
cd $PBS_O_WORKDIR
export PATH=ABC
export LD_LIBRARY_PATH=ABC
./a.out
}}
もし[[EnvironmentModules]]とまぜるなら、moduleコマンドを...
#code(nonumber){{
#!/bin/bash
#PBS -q g3
#PBS -l nodes=g03:ppn=1
#PBS -j oe
if [[ $SHELL = *csh* ]]; then # csh/tcshユー...
source /etc/profile.d/modules.sh
fi
module load ABC
cd $PBS_O_WORKDIR
./a.out
}}
終了行:
pbsproを実行した際、環境変数はどうなるの？
ジョブサブミッションサイトでの環境変数をそのまま引き継げ...
「#PBS -V」を追加すれば、環境変数は引き継げられるが、計算...
もし~/.bashrcにて PATH=ABC:$PATH があれば、計算ノードでは...
「#PBS -V」を追加しないのなら、計算ノードでの環境変数は、...
qsubの中で特定の環境変数を使いたいのなら、qsub.shにその内...
#code(nonumber){{
#!/bin/bash
#PBS -q g3
#PBS -l nodes=g03:ppn=1
#PBS -j oe
cd $PBS_O_WORKDIR
export PATH=ABC
export LD_LIBRARY_PATH=ABC
./a.out
}}
もし[[EnvironmentModules]]とまぜるなら、moduleコマンドを...
#code(nonumber){{
#!/bin/bash
#PBS -q g3
#PBS -l nodes=g03:ppn=1
#PBS -j oe
if [[ $SHELL = *csh* ]]; then # csh/tcshユー...
source /etc/profile.d/modules.sh
fi
module load ABC
cd $PBS_O_WORKDIR
./a.out
}}
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