chaperone をテンプレートにして作成
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御アクセス頂き誠にありがとうございます。
当サイトは個人の備忘録として存在しております。
そのため、内容は極めて個人的な域をでず、故、内容には一切...
然るに、其の採用・参考は自己責任にてお願い申し上げます。...
誤字脱字、不明瞭、意味不明、駄文とのご感想の際には謹んで...
国語の学が弱い若輩故、文書きに長けておりませぬ故、深く恐...
気が向くままに描いた記事たち。小さく隅に置かれる記事でご...
~
&size(10){問い合わせ先：info_at_sysosa.jp &color(red){*};...
-R8(2026).10.5
AFusionを作ってみたが、解析画面が微妙..もうなんというかも...
秋の夜長、窓を開けお仕事しております.
-R8(2026).10.2
relionでNVIDIA MPS（Multi-Process Service）対応の sbatch....
-R8(2026).9.30
今更ながらcudaのNVIDIA MPS（Multi-Process Service）をslur...
-R8(2026).9.27
RAID6でHDDが３つ飛んでなんとかして見える状態になったスト...
オリジナルには存在していて、でも別のストレージにコピーで...
これを ddrescue でサルベージを実施したが無理でした...
-R8(2026).9.26
DeepEMhancerが 0.18 にupdateされてTensorFlow 2.21.0対応. ...
なので初回に JIT原因のタイムラグが発生しますが、以後は高...
-R8(2026).9.24
連休を使って blackwell対応な tensorflow-1.15 パッケージ(w...
まぁーcrYOLOを tensorflow-2.x対応にしてくれたらいいのだが..
-R8(2026).9.22
tensorflow 1.xは既に開発終了なのですが、nvidia様がパッケ...
っでnvidia様は「tensorflow 1.xが入ったコンテナを使ってね...
-R8(2026).9.15
ebayでHBA「LSI 9300-8E」を購入. 31$. これが9400-8Eになる...
-R8(2026).9.5
slurmでrelion. 複数台の計算ノードを繋いで計算してみた. リ...
-R8(2026).8.22
Headscaleをようやく作り上げた. これって研究所と自宅のプラ...
Chrome Remote Desktopは情報システム側の取り組みで制御でき...
-R8(2026).8.18
参加費 22,000円かぁ...見たい内容盛りだくさんなんだよなぁ...
-R8(2026).8.12
slurmにて一定時間使われない計算ノードを休止にして、ジョブ...
これとテスト環境 proxmox で作ってみた. 機能しました. idle...
-R8(2026).8.9
389DSにcockpitへのpluginがある. けどどうも動かない. 設定...
ソースを取得してrpmbuildしても同じ結果だった. ちょっとし...
slurmのPOWER SAVE機能を試している. 指定した時間内に計算ノ...
-R8(2026).8.6
389DSを作ってみた. openldapとは違って dsidm で操作が出来...
-R8(2026).8.5
ubuntu22.04にてlvmでボリュームを追加してresize2fsでファイ...
i-nodeが足らんと言われたが df -i でみたらまだまだ余裕. ど...
っで追加となるとi-nodeが足らんと言われた次第. っでxfsボリ...
-R8(2026).7.25
macOSを勉強中
-R8(2026).7.23
ほぼ毎日外出. 焦げそう..slurmでジョブが来ないマシンを停止...
叩き起こされてジョブをこなすみたい. まぁーbootに5min位要...
-R8(2026).7.16
重い荷物を運んだためか筋肉痛..背中が痛い.. 「RTX PRO 600...
４分割までできるみたい。なので24GBのGPUが4つあるように使...
無理っぽく手動で変更が必要みたい. 96GBまるまる使う仕事で...
-R8(2026).7.9
久々にawsに取り組んでいる.
-R8(2026).7.2
文月かぁ.
-R8(2026).6.26
coot-0.9.8.96をrockylinux9.8で構築. 0.9系列は0.9.8.96で終...
coot-1.x系は最新 1.3.1 を同じくrockylinux9.8で作ったけど...
-R8(2026).6.17
日差しは強いのに日陰に入ると涼しさを感じる. 今だけなのだ...
blackwellに未対応なアプリ. chatgptとかで修正できるのだろ...
-R8(2026).5.26
RTX PRO2000でllmローカル環境を作ってみた. 簡単に用意でき...
-R8(2026).5.23
10Gbps -> 1250 MB/sec. sata SSDはよくて500MB/sec. PCIe 3....
nvme(pcie 3.0) で構成されるceph/zfsを作れば 各計算ノード...
nvme(pci3 4.0) なら7,000 MB/sec なので、nicは 50Gbps(6,25...
-R8(2026).5.21
rockylinux8にslurmならcgroups v2にすれば行けると思ったが...
どうもcgroups v2にはrockylinux9からっぽい. 10時間以上ぶっ...
openldapのコンテナだけど、結構いい感じ. samba-adのコンテ...
-R8(2026).5.11
RAIDカードって結構高価になって驚く. ならzfsでもいいような...
zfsも一応できるけど、思想的には初めに構築して、それを使い...
-R8(2026).5.8
slackにcephとかzfsの通知が届くには？って検討中
どうも、ちょっと仕事して横になってまた仕事しての繰り返し...
-R8(2026).5.3
認識が間違っていた. POSIX ACLってnfs先では面倒なNFSv4_set...
どうも NFS version3なら従来の簡単に使える setfacl/getfacl...
-R8(2026).4.28
最近のRAIDカードって無口になったみたい. 煩いサーバ室で声...
っでメール機能で伝える事になるのだが、古い仕様で直接外部...
あとzfs君. 異常時にLEDの赤色常点灯してくれない. まぁceph...
-R8(2026).4.23
連休中はzfsを試そうかな. 「special vdev」を用意することで...
-R8(2026).4.20
課題をひとつひとつ片づけている. 終わんねぇ.
-R8(2026).4.18
年度末が終わってもまだ忙しぃ.
結局cephのsmbモジュールだけど上手く動かない..なのでcephの...
samba の vfs ceph を試みたけど上手く動かない.. 何がダメだ...
-R8(2026).4.14
relion-5.1.0 リリース おめでとうございます.
-R8(2026).4.10
知らんかった. slurmでpartition(queue)に優先順位を付けてジ...
-R8(2026).4.8
共同利用なcryoSAPRCにてログインユーザに応じてslurmで同時...
あとはcryoSPARC稼働ユーザ(cryosparc)にも紐づける. これで...
-R8(2026).4.7
cephのsmbモジュールdomain対応版ができた. 深すぎる..
-R8(2026).4.4
slurmでcryoSPARCを利用する際、ログインユーザ毎に「3ジョブ...
-R8(2026).4.3
chatGPTをよく使うようになった. 手元にあるpro2000(16GB,Bla...
-R8(2026).4.1
slurmを構築中. 計算ノードによってはブート中 /dev/nvidia0 ...
この場合は nvidia-persistenced.service を用意して slurmd....
-R8(2026).3.30
よくよく調べるとPascal(10x0)は580系nvidiaドライバまでで、...
Volta,Turing(20x0)は590,595系はok、voltaは12.x(前半まで)...
blackwell(50x0)は590,595系は当然okだが、cuda12.x(後半)か...
-R8(2026).3.29
年度末まで忙しい..来月は休みたいなぁ.
-R8(2026).3.28
ceph Tentacleで構築してみたがnative ceph mountが駄目っぽ...
NFS-Ganeshaならうまく動く.
-R8(2026).3.19
3.16にcyroSPARC 5.0.3 がリリースしてた.
-R8(2026).3.18
クローズド環境のcephにosdを追加することに. cephadmのpodma...
コンテナimagesを加えるosdに入ってればいいみたい. 「podman...
-R8(2026).3.11
cephを年度末３年連続で作っている. Tentacle(20.2.0)が出た...
-R8(2026).3.5
FreeIPAサーバで大事故. webが機能しなくなって３時間以上復...
結局再構築へ. １時間でできる. nisの方が楽は楽。でもRHEL系...
-R8(2026).3.4
incusコンテナでcryoSPARCを作ってみた. /home提供のnfsサー...
肥大化するdbをローカルに配置しつつ、複数のcsを立ち上げれ...
-R8(2026).2.20
cryoSPARCのデータベースはnfs先に置いてはダメ. ファイルが...
サイズが小さいと問題ないっぽいが、大きくなるとやばげ. cry...
-R8(2026).2.14
cryoSPARC v5.0.2 がリリースです. updateが迅速ですね.
-R8(2026).2.13
RHEL9向けのchimeraX-1.11.1ですが、ダウンロードファイルが...
-R8(2026).2.5
RTX PRO2000を載せる検証マシンを註文した. 届くまでblackwel...
目下topazはblackwellでも大丈夫だけどcrYOLOは厳しいかなcpu...
-R8(2026).2.3
chimeraX 1.11.1が1/22にリリースされて、RHEL9系でも使える...
-R8(2026).1.31
「Failed to search for file: GDBus.Error:org.freedesktop....
「dnf remove PackageKit-command-not-found」で消していいか...
-R8(2026).1.28
cryoSPARC v5 リリース おめでとうございます.
RHEL8系、ubuntu20.04以降が必要で、nvidiaドライバーは570.2...
-R8(2026).1.24
結局検証マシンへのRTX PRO2000だが、搭載したらVGAが効かな...
RTX PRO2000向けに構築したアプリがA2000で動くのかを検証し...
-R8(2026).1.22
nvidia-cuda-mps-serverを使って効率よくGPUを使うのは構わな...
残っていると他の方がGPUを使えなくなるので.
-R8(2026).1.21
悲報.. 検証用マシンがPRO2000を認識しない..
-R8(2026).1.16
RTX PRO2000が届いた. 16GBなのである程度は使えそう. AI推論...
-R8(2026).1.8
chimeraX 1.11 はRHEL9向けにrpmを提供してますが、OpenSSL3....
ならOpenSSL3.3を淹れたとなりますが、OpenSSLなので他への影...
flatpak版を解体して入れて、module loadの中でOpenSSL3.3を...
-R8(2026).1.7
alphafold3をblackwellで動かす際はそのままでは無理みたい. ...
-R8(2026).1.6
クラスターノードだからとて計算ノードから直接外部への接続...
firewalldによるtrusted/externalゾーンを作るのが楽なのだが...
一応別法として「firewall-cmd --zone=trusted --add-interfa...
-R8(2026).1.5
samba-active directoryを久々に試した. 調べてたらRHEL8系で...
使えてた模様. だが、RHEL9系ではFreeIPAにディレクトリ管理...
FreeIPAでsec=krb5によるnfsで遅延なくログイン出来ればそれ...
-R8(2026).1.1
謹賀新年
-R7(2025).12.31
以前dnsmasq経由のFreeIPAサーバでsec=krb5ベースのnfsを作っ...
っでdnsmasqではなくFreeIPA内部のDNSに切り替えて作ってみた...
-R7(2025).12.27
今年の仕事はまだまだ続く.
nicが繋がらないマシンが出てきた. portがお亡くなり？って思...
10Gbps portなら修理させたいが、1Gbpsなら usb-nic で手軽に...
-R7(2025).12.24
ipmiがあったら現地に行かなくてもいいのに..っと今後の保険...
blackwellなGPUを買う予定でPCの新調を考えたが無期限延期. ...
-R7(2025).12.23
vpn接続で、これまでスマフォのテザリングでしか繋がらないっ...
RTX830で難しかったが、TCP1723とGREを許可するだけだった...
-R7(2025).12.17
relionにはblackwell向けのconda環境yamlがあるが、これを使...
environment_blackwell.ymlの末尾に".[vis]"を加えたら動き始...
-R7(2025).12.15
結局 fw の更新で問題は解消.
rockylinux10でEvinceは提供されず、代わりはMuPDFかOkular. ...
-R7(2025).12.12
手動で操作すると有効で、再起動すると無効になる. 有効状態...
あるいは「/etc/modprobe.d/mlnx.conf」に「options mlx5_en...
-R7(2025).12.10
あのシステムはvmwareで構成されていると思っていたが、今はK...
データプッシュ機能を付けてほしいなぁ. QNAP OS内でautofsは...
-R7(2025).12.7
phenix が 2.0-5885(2025/11/18) になっていた. python3ベー...
-R7(2025).11.27
FreeIPAでslurmをテスト中. 子ノードへのssh接続が鍵関係なし...
-R7(2025).11.26
なんか多忙..
RHEL9系でpython2.7を使う事に. python2.7系はOpenSSL 1.0/1....
なので「make -k」でSSLテストを回避してmakeすればいいみたい.
-R7(2025).11.18
blackwellですがcrYOLOが上手く動かない. こちらtensorflow v...
独自にソースからtensorflowをコンパイルすれば行けるでしょ...
-R7(2025).11.9
初のblackwell. cryoSPARC向けのtopaz-0.2.5が上手く作れいな...
ワーニングは出ますが、計算は出来ている.
-R7(2025).11.5
[[whisper]]を構築して音声データを文字お越しさせてみた.
-R7(2025).11.3
windowsPCをproxyサーバにした場合を記事にしてみた. あと同...
vscodeにて多段ssh接続も書く予定. vscodeにX11サーバ機能が...
-R7(2025).10.30
ChatGPTをよく利用するようになった. コンパイルでエラーがで...
局所的な解決には素晴らしいアイテム. でも使い方が周知され...
-R7(2025).10.28
nvidiaを新しくしたらchimeraのリモート表示が出来なくなった...
まぁwindows版chimeraを入れて、smb共有フォルダを使えば済む...
-R7(2025).10.16
cryoSPARCの記事が古くなっているから、近く更新予定.
-R7(2025).10.3
ぁっ、relion-5.0のメンテナンスリリースがありまして、5.0.1...
nfs領域にはsetfacl/getfaclが使えない. 専用のNFSv4 ACLで定...
ceph,glusterfsがある. cephは大規模. １台で用意可能となれ...
-R7(2025).9.30
chaytGPTにて「FreeIPAドメインにドメイン外のwindows/macPC...
出来ないはずなのにできるようになったの？って多少ウキウキ...
ここで記載したようにパスワード二重管理(FreeIPAとsamba)な...
-R7(2025).9.28
RStudio Desktopをソースから作ろうとやってみたが、、RStudi...
-R7(2025).9.23
Incusを試してみた。動作は軽量。けっこういいかも。Incusの...
-R7(2025).9.20
Incus の「システムコンテナ」ならネットワークはVM と同等に...
１台に複数のcryoSPARCを立てる際、表の39000なbase portは互...
この回避に仮想VMを提案しているのだが、リソース効率が悪く...
まぁー１つのcryoSPARCで運用すれば？ってなりますが、、デー...
-R7(2025).9.13
RL9で pyqt4 の構築は無理っぽい..っというか単に当方の力不...
ChatGPTに課金した. その解答には概ね満足. っが結局は自分で...
-R7(2025).9.10
Rockylinux9に入れたphenixからpymolを呼び出したいのですが...
ならばとでpython27向けのpymolを作っているが、連携にpyqt4...
-R7(2025).9.1
chatGPTをよく使うようになった. 合っている時もあるけどそう...
-R7(2025).8.21
Teamviewer/AnyDesk経由でアクセスする際、計算機にモニター...
これを計算機に取り付けるとあたかもモニターが接続されてい...
-R7(2025).8.20
coot v1.1.x版をソースから作ってみた. flathubで容易に導入...
napari. プラグインが多々あるから自分の場所に入れた方がよ...
-R7(2025).8.16
AMDのVGAカードを調べた. RDNA2/RDNA3世代の製品においてROCm...
tensorflowはまだの様子. まだまだnvidia様ですなぁ. RTX PRO...
-R7(2025).8.15
rockylinux8で使えるUSB-LANアダプター「LUA5-U3-AGTE-WH/BK...
オリジナルの
-R7(2025).8.13
cryoSPARC v4.7.1 にパッチが出たみたい.
-R7(2025).8.12
調べていたら、、結局「Bootable Container Image」ってqemu...
libvrtでの仮想OSは中に入ってdnfでOSをメンテするけど、「Bo...
cryoSPARCなDockerfileがあれば、１台のマシンに最終的にはqe...
あるのはDockerfileの修正だけで仮想マシンが作れるよって感...
そのDockerfileだけど、kickstartで代替できるから...まぁDoc...
-R7(2025).8.11
「Bootable Container Image」を使えば仮想マシンのようにloc...
そうなると普通のdockerでは無理でしたcryoSPARCの複数contai...
これをcontainer化できれば、より多くのcryoSAPRCインスタン...
-R7(2025).8.9
ぁ、３連休なのね. 忘れてた.
-R7(2025).8.7
flathubにcoot 1.1.18が乗っていた. flatpakで構築できるとは...
-R7(2025).8.3
software-raidのmdadmの並列度を増す方法 「echo 16 > /sys/b...
nvme software-raidでGPUを使っての高速があるみたい. [[http...
-R7(2025).7.27
cephでHDD消費に偏りが発生. どうも「.mgr」プールがまずかっ...
「.mgr」は既定だとHDDとSSDを区別なく使うcrush ruleが適用...
「.mgr」にSSDを使うruleを適用したら自動的にrebalanceが機...
CBI学会年会に参加したいが高いなぁ...たまに勉強する機会を...
-R7(2025).7.25
topazだけど、python3.6とpytorch2の組み合わせは無理みたい....
ならpython3.6とtorch 1.xなら行けるが、torch 1.xは最新のnv...
以前はokだったのに最新nvidiaドライバだと無理かぁ.. Blackw...
-R7(2025).7.22
作業が遅く課題が積み上がる...Blackwell(50x0)カードを調達...
-R7(2025).7.18
RTX50向けな tensorflow の whlファイルが作れるみたい. ぁ、...
前言撤回
-R7(2025).7.17
Blackwell(50x0) だが、IsoNet, crYOLO, cryoCARE, deepEMhan...
未対応のtensorflowが使われているのが原因っぽい. 今後更新...
-R7(2025).7.11
アテロームが再発して....腰に発生. 正直なれているけどしん...
-R7(2025).7.9
今日からインターフェックスなのだが...参加したかった..
-R7(2025).7.4
BlackwellでcryoSPARC. master/worker共に v471-cuda12 にす...
570.26はMaxwell(GTX TITAN X, Quadro M6000とか), Pascal(GT...
-R7(2025).7.2
昨日から妙に腰が痛む...
-R7(2025).6.25
RL10でchimera, relionらを試さねば.. Xwaylandでこれらが描...
nfs4-acl-toolsが使いにくい..
-R7(2025).6.22
chimera-1.16 軽量なのでよく利用するのですが、nvidia 535 ...
ただ nvidia のインストールの際「NVIDIA-Linux-x86_64-570.1...
-R7(2025).6.20
cyroSPARC 4.7.1リリース. 4.7.1の枝番version"v4.7.1-cuda12...
OS側でGLIBC 2.28以上なので rockylinux8(glibc 2.28) ubuntu...
枝番じゃない 4.7.1 へのupdateは今までの継承(要nvidia 520...
-R7(2025).6.19
ipmi越しにOSの再インストール. 「Virtual Media」にisoを定...
その場合はnetbootの要領で進める. [[参照>+https://www.serv...
今回も不参加. 積み上がった課題を只管こなしている.
-R7(2025).6.14
6.11にrockylinux10(RL10)がリリースされたみたい. kernalが6...
Pythonは3.12ベースへとかとか [[https://docs.rockylinux.or...
-R7(2025).6.10
体調不良. 事務所でお仕事. OS更新に伴うdockerの移行を考え...
docker saveでtarを作ってそれを新OSに持って行って docker l...
-R7(2025).6.8
macOSにanaconda/minicondaを敷いてconda create/installをす...
-R7(2025).5.22
napari-cryoloの構築でエラーが出た. 関連パッケージのversio...
-R7(2025).5.21
freeipaでsmbを要するにはdomain参加が必要だが、パスワード...
これまで通りsmbpasswdで定義したパスワードでsmbアクセスは...
-R7(2025).5.14
freeipaをやっている. ntlm無効の局面に備えて勉強中. ログイ...
暫くすると再発する. mountオプションをsec=krb5からsec=sys...
-R7(2025).5.3
centos7に570.xxx(12.8)、565.xxx、560.xxx(12.6)、555.xxx(1...
-R7(2025).5.1
私用で不在です.
-R7(2025).4.26
VMware ESXiが再度無償版となって使えるそうな. Proxmoxに移...
無償版がv8.0から. v7.0とは画面構成が若干違うみたい.
-R7(2025).4.23
cephadmでsambaコンテナを使えるべくテストを続けているが、...
どこかのノードでcephをmountして、そこでsmbを出せば事足り...
-R7(2025).4.18
cryoSPARC の最新版がでて1week. パッチ提供らはない模様で大...
AMD GPU の Radeon でrelionは動くそうな. ちょいと試してみ...
-R7(2025).4.10
cryoSPARC 4.7.0がリリースされました. 心よりお祝い申し上げ...
っがリリース直後ってパッチ提供がすぐあるのが最近の傾向. 1...
-R7(2025).4.7
r9.4にてssh接続が遅い.
「GSSAPIAuthentication no」で回避. あとdns resolvの問題. ...
-R7(2025).4.3
もうちょい休む.
-R7(2025).3.31
年度末. 疲れました. 休みます.
-R7(2025).3.25
37.2微熱
-R7(2025).3.22
cifsでautofs.
auto.masterはいつも通り.
auto.homeは「/OffloadData -fstype=cifs,credentials=/etc/c...
-R7(2025).3.20
ubuntu24.04を扱っている. 画面にgnome-terminalが立ち上がら...
MotionCor2がlibtiff.so.5を求める. ubuntu24.04はlibtiff.so...
「/usr/local/」に入れとけばいいみたい.
-R7(2025).3.17
win10マシンを更新するかぁ...まだまだ十分に使えるのだが..
-R7(2025).3.15
software-RAIDで6本のHDDでRAID5を構築したら「cat /proc/mds...
っが、暫くして「UUUUUU」となる. RAID6ならはなっから「UUUU...
32core, 64coreとかあるならsoftwareRAIDでも良くね？って思...
-R7(2025).3.8
アテロームは切開手術せず、市販薬で抑えられるか試したら、...
手術は超ブルーで落ち込み、10日ほど毎日通院. ３月はさすが...
Rocky9で「transparent_hugepage=never」をgrubに仕込んでも...
-R7(2025).3.4
beegfsのmeta向けSSDのi-nodeが溢れて機能停止. 62Mのi-node...
別途SSDを「-i 2048」でmkfs.ext4して、490Mのi-nodeに増やし...
「rsync -a」ではxattrが移らない. 「rsync -aX」で移せるが...
-R7(2025).2.28
アテローム再発. 歩くと痛い. 忙しい時に再発である..
-R7(2025).2.15
rockylinux8ではcryoSPARCにて「io_uring」のWARNINGが表示さ...
なので対応のしようがない. rockylinux9に上げるか、ELRepoの...
-R7(2025).2.13
cephにwindowsクライアントアプリがあるのね. [[https://clou...
これでsmbを立てなくても行けるか.
-R7(2025).2.12
OpenIDを作りたくなってきた.
-R7(2025).2.8
cryoSPARCでデータベースが正しく起動しない件.
そのデータベースがnfs先にあるなら file lock 機構が効いて...
-R7(2025).2.3
先週、食あたりを受けた. 今も微妙..
-R7(2025).1.8
topaz v0.3.5が出てたので改定. 「3D particle-picking」がで...
いずれはmasterに統合なのでしょうけど、触ってみたい方に.
-R7(2025).1.1
謹賀新年
21世紀も四分の１かぁ. 昭和100年. 大正114年. 明治158年. 平...
-R6(2024).12.26
また風邪になったみたい..
-R6(2024).12.24
腰痛が復活？
-R6(2024).12.22
すごいなぁ. Boltz-1 [[https://jclinic.mit.edu/boltz-1/>+h...
AF3の精度を有する3D予測アプリ. 学術、商用問わず利用可能の...
-R6(2024).12.17
ジョブ管理にGrid Engineを使っているサイトでcryoSPARC. ジ...
updateのたびに修正かぁ...
-R6(2024).12.15
VirtualGLでvncを動かしたら画面が真っ黒. まれにあるみたい....
lightdmはディスプレイサーバ Wayland に現状未対応. ディス...
-R6(2024).12.13
ChimeraX 1.9リリース
-R6(2024).12.5
relion-5.0.0リリースおめでとうございます.
とある理由でEMPIARのデータが必要になった. 本家ではAspera...
なのでPDBj様でEMPIARのデータを取得. rsyncで取れるのが嬉し...
-R6(2024).12.4
とある場所でcryoSPARCのデータベースが復旧不可能になった. ...
既存のプロジェクトディレクトリをattach操作したら一応は復...
-R6(2024).11.30
風邪の症状が治まった. 咳はほとんど出てない. ようやく終わ...
っで寝込んでいた時に気の迷いでボタンを押したteslaのカード...
-R6(2024).11.20
引き続き絶賛(ry. 寝込んでいてebayを見ていたら10x0時代のt...
-R6(2024).11.19
絶賛風邪の中. cryoSPARC v4.6.2がリリース.
-R6(2024).11.18
とあるところでcryoSPARCのClass2DがGPUが落ちた.「export CR...
ネタは[[ここ>+https://discuss.cryosparc.com/t/assistance-...
-R6(2024).11.16
風邪ひいた..
-R6(2024).11.15
cryoSPARCを動かすホストの名称は全て小文字で構成された方が...
大文字を含むホスト名とipがあれば無事起動できたのだが、v4....
-R6(2024).11.14
cryoSPARC v4.6.1がリリース. 例の2DClassで落ちる現象も対処...
-R6(2024).11.12
AlphaFold3がリリースされたのね. 開発元は A100(80GB), H100...
4090/3090の24GBカードでもRAMを借用すれば動かすことが可能...
ユニファイドメモリーならmacOSも手なのだろうか？
-R6(2024).11.11
ひたすらcentos7->rockylinux8,9に揚げている. PXEbootでOSを...
結局ひとつひとつOS更新を行っている. 20,30台ならPXEbootな...
-R6(2024).11.6
slurm-webを作ってみた. squeue で足りそうな気がする.
vmware esxiの代替先としてProxmoxを使っている. 高度な使い...
-R6(2024).10.28
cgroups v2対応なOSは Ubuntu21.10以降(22.04LTSとか), RHEL9...
openPBSのgitを眺めていると ubuntu24 に対応とかあるけど、...
slurmはv1 v2とも対応済みの様子.
-R6(2024).10.19
ローカルにpostfixを立ててSMTPリレーをさせてみた. office36...
結構ハードルが高かったので断念. 代わりに回線プロバイダのS...
mobaXtermでcootが機能しない時がある. その際はmobaXtermのX...
-R6(2024).10.16
adaptecの8シリーズでmaxviewのメール設定を検討中. 中身はJa...
office365のSMTPは利用できない. TLS(SSL)なしの送信が許可さ...
ローカルにpostfixを立てて、そこを踏み台にoffice365へ転送...
-R6(2024).10.11
cryoSPARCのcluster運用にて. masterはジョブを発行するとき...
masterは停止、workerはそのまま働かせる. これなら行けるっ...
「Job is unresponsive - no heartbeat received in 180 seco...
workerを動かしている最中、masterも動いてないとダメらしい....
-R6(2024).10.8
cryoSPARC v4.6.0で2Dclassの際に落ちる. [[これ>+https://di...
kernelパラメータの調整が必要ってoracleかよ.
-R6(2024).9.27
アテローム発生...
-R6(2024).9.26
samba-ad関連の記事をupdate予定.
-R6(2024).9.25
samba-adとの接続でrockylinux8ならnslcd経由で行けたのに ro...
仕方ないので sssd経由にしたのだが、こちらユーザデータにpo...
samba-adで作ったアカウントにposixAccountは入ってなく別途...
-R6(2024).9.21
ルータ内にWireGuardを仕込めるかテストをしているのだが.......
firewall-cmdのexternal/trustedな仕掛けのまま使いたいのが...
-R6(2024).9.14
またヘルニアを痛めた模様。一応歩けるけど、前屈みすると痛...
長時間椅子に座ったから？ これじゃ仕事できないよぉ.. 連...
esxiの後釜としてProxmoxを使いだした. esxiで作った仮想マシ...
加えてGPUも使えて. なぜかesxiだと535までだったのがそれ以...
-R6(2024).9.11
cryoSPARC v4.6.0リリース. リリースノートを読むとこれがcen...
-R6(2024).9.5
[[VirtualGL]]を試している. 以前よりももっと簡単に動かせれ...
srunでリソースを確保してdockerにVirtualGLを仕立てれば、、...
-R6(2024).9.1
coot公式配布を無理やりRHEL9で動かしてみた. openssl-1.0.2...
-R6(2024).8.30
気が付けば葉月も終わり. 夏は暑い外と寒い鯖室の出入りで調...
cootの公式配布バイナリがRHEL8系までなのでRHEL9系向けを作...
まぁmac/winでcootが多いの需要は少ないのですが.
-R6(2024).7.26
階段を下りると痺れがでる. 普段の歩行は問題ないかな.
debパッケージの作り方を勉強中.
-R6(2024).7.15
Multi-Instance GPU(MIG)に興味を持ったが、TeslaのA30かA100...
GPUをインスタンス毎に分けて使える. virtualGLとかにも分け...
無理なのでp100かv100でも買おうかな.
-R6(2024).7.4
右脚の痺れは残っているけど、腰痛が厳しくなってきた. 右脚...
esxiでnvidia-550とか555が機能しない. 535なら大丈夫.
-R6(2024).6.25
ほぼ二か月が経過. 歩行に支障はない. 痺れはあるけど無視で...
anacondaを使われている所でminiforge/miniconda系への移行が...
-R6(2024).6.12
仕事に出かけたのだが、帰りはタクシーで帰宅. 右脚の痺れは...
また腰の部分に痛みが出てきた. 変な姿勢で歩いているのが原...
GAMESSを取り扱い始めた. mopac以来かな.
-R6(2024).6.5
あら cryoSPARC v4.5.3 がリリースです.
-R6(2024).6.4
一か月が過ぎた. ようやく歩ける(当社比1/2). ゆっくりなら行...
cryoSPARC v4.5.2がリリース
-R6(2024).5.27
3週間過ぎた. 当初痺れて10mも歩けなかったのが、リハビリと...
動きは酔歩に近いが動ける. 酔歩といえばMC...いやなんでもな...
-R6(2024).5.21
理学療法士様によるリハビリを受けた. 静養しつつリハビリ運...
お薬で痺れ痛みが緩和され、辛かった病院通いが随分と楽にな...
-R6(2024).5.20
relion5の連携condaアプリですが、relion5の更新に合わせて連...
relion5のsubtomogramでEMPIAR-10164のmrcはブラウザからとれ...
ここなのね ftp.ebi.ac.uk/empiar/world_availability/10164/...
-R6(2024).5.17
患って今日で２週間がたった. 今月中の外出は難しいかなぁ..
-R6(2024).5.15
整形外科に行ってレントゲン撮った. 坐骨神経痛が確定っぽい....
RHEL9系でcootをコンパイルできないか調査中.
手始めにRHEL7系のCentOS7でcootをコンパイルしてみているが...
-R6(2024).5.9
外出を試みるもほんの十数メートルで断念. 1week安静したけど...
ほんと歩けない....
-R6(2024).5.9
あら cryoSPARC v4.5.1 がリリースです. バグフィックスですね.
絶賛 坐骨神経痛は継続中. ほんと歩けない.. 毎日安静してます.
-R6(2024).5.8
cryoSPARC v4.5がリリース. [[https://cryosparc.com/updates...
引き続き坐骨神経痛で歩けないです...
-R6(2024).5.5
やばい..坐骨神経痛っぽい...歩けない..
-R6(2024).4.30
風邪ひいて38度まで上がった. ようやく平熱に戻ったけど喉が...
-R6(2024).4.25
CentOS7で800x600しか出なかった. っでelrepoのkernelに差し...
最新cpuの内蔵videoってcentos7は未対応？
-R6(2024).4.17
通院の毎日. ようやく多少座れるようになった.
-R6(2024).4.10
椅子には座れるけど、長時間は無理. 通院してガーゼ交換です...
-R6(2024).4.8
また切開手術...肩とは別の箇所.
-R6(2024).4.5
cryoSPARCのキャッシュについて. クラスターで運用すると時に...
計算ノードは固定しない. なのでキャッシュもどんどん分散さ...
っで終わっても消してくれないので運用上の悩みとなる。BeeON...
-R6(2024).4.4
Bioconductor 3.19はR-4.4向け. Bioconductor 3.19は5/1にリ...
-R6(2024).4.3
ubuntu22.04のrelionにて relion_python_* から「libcuda.so...
「/etc/ld.so.conf.d/」に/usr/local/cudaも入っているのだが...
仕方ないので modulefiles/relion で/usr/local/cudaを優先に...
毎日通院. 切開箇所のガーゼ交換なのですが、めちゃくちゃ痛...
-R6(2024).4.1
肩の方を切開手術.
-R6(2024).3.30
GPUマシンで計算が途中で止まるなら..
1.GPUのwattをdown 2.BIOSでPCIe GENを1にdown 3.kernelをup....
kernel upで成功したらwattをup, genをupして速度を上げてみ...
-R6(2024).3.28
病院行って切開は様子見.
-R6(2024).3.26
肩に傷ができて痛む..あと吹き出物も再発..今週中に病院かな...
-R6(2024).3.23
usbを刺してデータ転送をするとwaitが上がる. usbがダーティ？
linuxに刺す前にwinに刺して整合性を取ってみるのは意味があ...
-R6(2024).3.21
報告書ラッシュ. 寒の戻りなためか体が微妙.. 外出は取りやめ...
relion-5.0-beta-2がリリースされていた.
-R6(2024).3.15
確定申告,青色申告,消費税申告がやっと完成. 本日提出へ.
-R6(2024).3.11
cephのquotaを試したのだが...制限設置に10Giと定義できると...
判明するのに半日かよ..修練が足らない.
-R6(2024).3.6
CTFFIND5をコンパイル中. バイナリーは既に提供されてますが...
ctffind5を単体で用意してみたくてコンパイル中.
-R6(2024).3.4
締め切りに追われてます.
cryoSPARCのホスト名ですが、大文字でホスト名を持たせるなら...
小文字なら/etc/hostsはそのままでもok. 小文字ホスト名の方...
-R6(2024).3.1
2月は結構きつかった. 3月も相当な感じ. cootのrhel9系向けの...
-R6(2024).2.16
そうか. ハーゲンダッツを買う日か.
cryoSPARCにてupdateを実行しての何も動かない時はLD_LIBRARY...
-R6(2024).2.14
だいぶ楽になりました.
-R6(2024).2.13
nfsボリュームに対するACL(nfs4_setfacl/nfs4_getfacl)を試し...
今週いっぱい外勤しないつもり. 今時点階段を上るときっつい..
-R6(2024).2.10
PyMOL. tagのv2.5.0はRockylinuxでコンパイルできるけど、最...
look_atなるコマンドでコンパイルが落ちる. glm-develを上げ...
-R6(2024).2.9
吹き出物が再発して手術. 3,4日はあまり動けないかな. 以前も...
椅子に座ってのディスクワークには支障がないけど、外勤は厳...
-R6(2024).2.8
coot使うなら rockylinux8.x だなぁ. ubuntu22.04でもcootは...
ソースコードが公開されているから作れなくはないのでしょう...
nfsサーバは64GB メモリーかなぁ.
-R6(2024).2.6
REHL(本家)9.3を取得した. いわゆる個人向けで使うなら16台ま...
あくまでも個人向け. 事業とかそれを使って成果を出すなら本...
パッケージリポジトリが全く違っていたのに驚いて急遽議題に...
-R6(2024).2.2
ldapはfailover,ppolicy,lamの組み込み、slurmはslurmdbdとXD...
rootパスワは破棄かな. 管理者権限アカウントの創設とsudo. c...
zabbixとceph,mail連携. fail2ban. slurmにprolog/epilogを入...
-R6(2024).2.1
nfs client側でaclを付けたいと思った. nfs4-acl-toolsのnfs4...
cephfsはsetfaclコマンドで定義できるのだがnfs clientでsetf...
-R6(2024).1.30
ldapでアカウント管理. それにautomountも管理させたくてldap...
運用もいいのだが、台数が増えると集中管理がいいかなと. ま...
-R6(2024).1.28
LdapAdminのLinux版があった. これでldifを作らんでも楽に操...
このLdapAdmin(linux版)、Xmingでは微妙、mobaXtermならok. X...
-R6(2024).1.22
でっかいファイルシステムを構築中. いつも間にか手に汗がに...
system diskって実はext4にしてパーティションを動かせた方が...
-R6(2024).1.21
supermicroのMBでIPMI経由によるOS再インストールを試した. ...
SFT-DCMS-Singleライセンス(有償)が必要みたい.. 以前は追加...
gpartedで領域を小さくしようと思ったらxfsはダメ見たい. ext...
-R6(2024).1.19
仕事積みすぎた..土日で片付かせたい..
-R6(2024).1.10
次期リリースのphenix-1.21からMOPACが使えるとは...驚いた.
しかもMOPAC自体がオープンソースになっていてこれも驚いた.
-R6(2024).1.9
cephのreef. cephfsのみだけど手順確認. backendのcluster ne...
次はcephadmの習得かな.
-R6(2024).1.8
年始年末をcephの勉強に充てている. 以前Octopus(v15.x)で作...
cephadmの利用を前提としたdashboardが気になりますが、一通...
今後はcephadmベースで進むのでしょうが、docker/podmanの上...
こころはドキュメントをよく読んで進むしかないかなぁ.
-R6(2024).1.7
動作検証にvmware esxiを使っている. ebayでTeslaP40(GP102[G...
nvidiaの仮想GPUが使えそうなのよねぇ
-R6(2024).1.1
謹賀新年. 未達な課題が多くてすみません.
なんでまほよ?その前に月の裏側では.....
終了行:
御アクセス頂き誠にありがとうございます。
当サイトは個人の備忘録として存在しております。
そのため、内容は極めて個人的な域をでず、故、内容には一切...
然るに、其の採用・参考は自己責任にてお願い申し上げます。...
誤字脱字、不明瞭、意味不明、駄文とのご感想の際には謹んで...
国語の学が弱い若輩故、文書きに長けておりませぬ故、深く恐...
気が向くままに描いた記事たち。小さく隅に置かれる記事でご...
~
&size(10){問い合わせ先：info_at_sysosa.jp &color(red){*};...
-R8(2026).10.5
AFusionを作ってみたが、解析画面が微妙..もうなんというかも...
秋の夜長、窓を開けお仕事しております.
-R8(2026).10.2
relionでNVIDIA MPS（Multi-Process Service）対応の sbatch....
-R8(2026).9.30
今更ながらcudaのNVIDIA MPS（Multi-Process Service）をslur...
-R8(2026).9.27
RAID6でHDDが３つ飛んでなんとかして見える状態になったスト...
オリジナルには存在していて、でも別のストレージにコピーで...
これを ddrescue でサルベージを実施したが無理でした...
-R8(2026).9.26
DeepEMhancerが 0.18 にupdateされてTensorFlow 2.21.0対応. ...
なので初回に JIT原因のタイムラグが発生しますが、以後は高...
-R8(2026).9.24
連休を使って blackwell対応な tensorflow-1.15 パッケージ(w...
まぁーcrYOLOを tensorflow-2.x対応にしてくれたらいいのだが..
-R8(2026).9.22
tensorflow 1.xは既に開発終了なのですが、nvidia様がパッケ...
っでnvidia様は「tensorflow 1.xが入ったコンテナを使ってね...
-R8(2026).9.15
ebayでHBA「LSI 9300-8E」を購入. 31$. これが9400-8Eになる...
-R8(2026).9.5
slurmでrelion. 複数台の計算ノードを繋いで計算してみた. リ...
-R8(2026).8.22
Headscaleをようやく作り上げた. これって研究所と自宅のプラ...
Chrome Remote Desktopは情報システム側の取り組みで制御でき...
-R8(2026).8.18
参加費 22,000円かぁ...見たい内容盛りだくさんなんだよなぁ...
-R8(2026).8.12
slurmにて一定時間使われない計算ノードを休止にして、ジョブ...
これとテスト環境 proxmox で作ってみた. 機能しました. idle...
-R8(2026).8.9
389DSにcockpitへのpluginがある. けどどうも動かない. 設定...
ソースを取得してrpmbuildしても同じ結果だった. ちょっとし...
slurmのPOWER SAVE機能を試している. 指定した時間内に計算ノ...
-R8(2026).8.6
389DSを作ってみた. openldapとは違って dsidm で操作が出来...
-R8(2026).8.5
ubuntu22.04にてlvmでボリュームを追加してresize2fsでファイ...
i-nodeが足らんと言われたが df -i でみたらまだまだ余裕. ど...
っで追加となるとi-nodeが足らんと言われた次第. っでxfsボリ...
-R8(2026).7.25
macOSを勉強中
-R8(2026).7.23
ほぼ毎日外出. 焦げそう..slurmでジョブが来ないマシンを停止...
叩き起こされてジョブをこなすみたい. まぁーbootに5min位要...
-R8(2026).7.16
重い荷物を運んだためか筋肉痛..背中が痛い.. 「RTX PRO 600...
４分割までできるみたい。なので24GBのGPUが4つあるように使...
無理っぽく手動で変更が必要みたい. 96GBまるまる使う仕事で...
-R8(2026).7.9
久々にawsに取り組んでいる.
-R8(2026).7.2
文月かぁ.
-R8(2026).6.26
coot-0.9.8.96をrockylinux9.8で構築. 0.9系列は0.9.8.96で終...
coot-1.x系は最新 1.3.1 を同じくrockylinux9.8で作ったけど...
-R8(2026).6.17
日差しは強いのに日陰に入ると涼しさを感じる. 今だけなのだ...
blackwellに未対応なアプリ. chatgptとかで修正できるのだろ...
-R8(2026).5.26
RTX PRO2000でllmローカル環境を作ってみた. 簡単に用意でき...
-R8(2026).5.23
10Gbps -> 1250 MB/sec. sata SSDはよくて500MB/sec. PCIe 3....
nvme(pcie 3.0) で構成されるceph/zfsを作れば 各計算ノード...
nvme(pci3 4.0) なら7,000 MB/sec なので、nicは 50Gbps(6,25...
-R8(2026).5.21
rockylinux8にslurmならcgroups v2にすれば行けると思ったが...
どうもcgroups v2にはrockylinux9からっぽい. 10時間以上ぶっ...
openldapのコンテナだけど、結構いい感じ. samba-adのコンテ...
-R8(2026).5.11
RAIDカードって結構高価になって驚く. ならzfsでもいいような...
zfsも一応できるけど、思想的には初めに構築して、それを使い...
-R8(2026).5.8
slackにcephとかzfsの通知が届くには？って検討中
どうも、ちょっと仕事して横になってまた仕事しての繰り返し...
-R8(2026).5.3
認識が間違っていた. POSIX ACLってnfs先では面倒なNFSv4_set...
どうも NFS version3なら従来の簡単に使える setfacl/getfacl...
-R8(2026).4.28
最近のRAIDカードって無口になったみたい. 煩いサーバ室で声...
っでメール機能で伝える事になるのだが、古い仕様で直接外部...
あとzfs君. 異常時にLEDの赤色常点灯してくれない. まぁceph...
-R8(2026).4.23
連休中はzfsを試そうかな. 「special vdev」を用意することで...
-R8(2026).4.20
課題をひとつひとつ片づけている. 終わんねぇ.
-R8(2026).4.18
年度末が終わってもまだ忙しぃ.
結局cephのsmbモジュールだけど上手く動かない..なのでcephの...
samba の vfs ceph を試みたけど上手く動かない.. 何がダメだ...
-R8(2026).4.14
relion-5.1.0 リリース おめでとうございます.
-R8(2026).4.10
知らんかった. slurmでpartition(queue)に優先順位を付けてジ...
-R8(2026).4.8
共同利用なcryoSAPRCにてログインユーザに応じてslurmで同時...
あとはcryoSPARC稼働ユーザ(cryosparc)にも紐づける. これで...
-R8(2026).4.7
cephのsmbモジュールdomain対応版ができた. 深すぎる..
-R8(2026).4.4
slurmでcryoSPARCを利用する際、ログインユーザ毎に「3ジョブ...
-R8(2026).4.3
chatGPTをよく使うようになった. 手元にあるpro2000(16GB,Bla...
-R8(2026).4.1
slurmを構築中. 計算ノードによってはブート中 /dev/nvidia0 ...
この場合は nvidia-persistenced.service を用意して slurmd....
-R8(2026).3.30
よくよく調べるとPascal(10x0)は580系nvidiaドライバまでで、...
Volta,Turing(20x0)は590,595系はok、voltaは12.x(前半まで)...
blackwell(50x0)は590,595系は当然okだが、cuda12.x(後半)か...
-R8(2026).3.29
年度末まで忙しい..来月は休みたいなぁ.
-R8(2026).3.28
ceph Tentacleで構築してみたがnative ceph mountが駄目っぽ...
NFS-Ganeshaならうまく動く.
-R8(2026).3.19
3.16にcyroSPARC 5.0.3 がリリースしてた.
-R8(2026).3.18
クローズド環境のcephにosdを追加することに. cephadmのpodma...
コンテナimagesを加えるosdに入ってればいいみたい. 「podman...
-R8(2026).3.11
cephを年度末３年連続で作っている. Tentacle(20.2.0)が出た...
-R8(2026).3.5
FreeIPAサーバで大事故. webが機能しなくなって３時間以上復...
結局再構築へ. １時間でできる. nisの方が楽は楽。でもRHEL系...
-R8(2026).3.4
incusコンテナでcryoSPARCを作ってみた. /home提供のnfsサー...
肥大化するdbをローカルに配置しつつ、複数のcsを立ち上げれ...
-R8(2026).2.20
cryoSPARCのデータベースはnfs先に置いてはダメ. ファイルが...
サイズが小さいと問題ないっぽいが、大きくなるとやばげ. cry...
-R8(2026).2.14
cryoSPARC v5.0.2 がリリースです. updateが迅速ですね.
-R8(2026).2.13
RHEL9向けのchimeraX-1.11.1ですが、ダウンロードファイルが...
-R8(2026).2.5
RTX PRO2000を載せる検証マシンを註文した. 届くまでblackwel...
目下topazはblackwellでも大丈夫だけどcrYOLOは厳しいかなcpu...
-R8(2026).2.3
chimeraX 1.11.1が1/22にリリースされて、RHEL9系でも使える...
-R8(2026).1.31
「Failed to search for file: GDBus.Error:org.freedesktop....
「dnf remove PackageKit-command-not-found」で消していいか...
-R8(2026).1.28
cryoSPARC v5 リリース おめでとうございます.
RHEL8系、ubuntu20.04以降が必要で、nvidiaドライバーは570.2...
-R8(2026).1.24
結局検証マシンへのRTX PRO2000だが、搭載したらVGAが効かな...
RTX PRO2000向けに構築したアプリがA2000で動くのかを検証し...
-R8(2026).1.22
nvidia-cuda-mps-serverを使って効率よくGPUを使うのは構わな...
残っていると他の方がGPUを使えなくなるので.
-R8(2026).1.21
悲報.. 検証用マシンがPRO2000を認識しない..
-R8(2026).1.16
RTX PRO2000が届いた. 16GBなのである程度は使えそう. AI推論...
-R8(2026).1.8
chimeraX 1.11 はRHEL9向けにrpmを提供してますが、OpenSSL3....
ならOpenSSL3.3を淹れたとなりますが、OpenSSLなので他への影...
flatpak版を解体して入れて、module loadの中でOpenSSL3.3を...
-R8(2026).1.7
alphafold3をblackwellで動かす際はそのままでは無理みたい. ...
-R8(2026).1.6
クラスターノードだからとて計算ノードから直接外部への接続...
firewalldによるtrusted/externalゾーンを作るのが楽なのだが...
一応別法として「firewall-cmd --zone=trusted --add-interfa...
-R8(2026).1.5
samba-active directoryを久々に試した. 調べてたらRHEL8系で...
使えてた模様. だが、RHEL9系ではFreeIPAにディレクトリ管理...
FreeIPAでsec=krb5によるnfsで遅延なくログイン出来ればそれ...
-R8(2026).1.1
謹賀新年
-R7(2025).12.31
以前dnsmasq経由のFreeIPAサーバでsec=krb5ベースのnfsを作っ...
っでdnsmasqではなくFreeIPA内部のDNSに切り替えて作ってみた...
-R7(2025).12.27
今年の仕事はまだまだ続く.
nicが繋がらないマシンが出てきた. portがお亡くなり？って思...
10Gbps portなら修理させたいが、1Gbpsなら usb-nic で手軽に...
-R7(2025).12.24
ipmiがあったら現地に行かなくてもいいのに..っと今後の保険...
blackwellなGPUを買う予定でPCの新調を考えたが無期限延期. ...
-R7(2025).12.23
vpn接続で、これまでスマフォのテザリングでしか繋がらないっ...
RTX830で難しかったが、TCP1723とGREを許可するだけだった...
-R7(2025).12.17
relionにはblackwell向けのconda環境yamlがあるが、これを使...
environment_blackwell.ymlの末尾に".[vis]"を加えたら動き始...
-R7(2025).12.15
結局 fw の更新で問題は解消.
rockylinux10でEvinceは提供されず、代わりはMuPDFかOkular. ...
-R7(2025).12.12
手動で操作すると有効で、再起動すると無効になる. 有効状態...
あるいは「/etc/modprobe.d/mlnx.conf」に「options mlx5_en...
-R7(2025).12.10
あのシステムはvmwareで構成されていると思っていたが、今はK...
データプッシュ機能を付けてほしいなぁ. QNAP OS内でautofsは...
-R7(2025).12.7
phenix が 2.0-5885(2025/11/18) になっていた. python3ベー...
-R7(2025).11.27
FreeIPAでslurmをテスト中. 子ノードへのssh接続が鍵関係なし...
-R7(2025).11.26
なんか多忙..
RHEL9系でpython2.7を使う事に. python2.7系はOpenSSL 1.0/1....
なので「make -k」でSSLテストを回避してmakeすればいいみたい.
-R7(2025).11.18
blackwellですがcrYOLOが上手く動かない. こちらtensorflow v...
独自にソースからtensorflowをコンパイルすれば行けるでしょ...
-R7(2025).11.9
初のblackwell. cryoSPARC向けのtopaz-0.2.5が上手く作れいな...
ワーニングは出ますが、計算は出来ている.
-R7(2025).11.5
[[whisper]]を構築して音声データを文字お越しさせてみた.
-R7(2025).11.3
windowsPCをproxyサーバにした場合を記事にしてみた. あと同...
vscodeにて多段ssh接続も書く予定. vscodeにX11サーバ機能が...
-R7(2025).10.30
ChatGPTをよく利用するようになった. コンパイルでエラーがで...
局所的な解決には素晴らしいアイテム. でも使い方が周知され...
-R7(2025).10.28
nvidiaを新しくしたらchimeraのリモート表示が出来なくなった...
まぁwindows版chimeraを入れて、smb共有フォルダを使えば済む...
-R7(2025).10.16
cryoSPARCの記事が古くなっているから、近く更新予定.
-R7(2025).10.3
ぁっ、relion-5.0のメンテナンスリリースがありまして、5.0.1...
nfs領域にはsetfacl/getfaclが使えない. 専用のNFSv4 ACLで定...
ceph,glusterfsがある. cephは大規模. １台で用意可能となれ...
-R7(2025).9.30
chaytGPTにて「FreeIPAドメインにドメイン外のwindows/macPC...
出来ないはずなのにできるようになったの？って多少ウキウキ...
ここで記載したようにパスワード二重管理(FreeIPAとsamba)な...
-R7(2025).9.28
RStudio Desktopをソースから作ろうとやってみたが、、RStudi...
-R7(2025).9.23
Incusを試してみた。動作は軽量。けっこういいかも。Incusの...
-R7(2025).9.20
Incus の「システムコンテナ」ならネットワークはVM と同等に...
１台に複数のcryoSPARCを立てる際、表の39000なbase portは互...
この回避に仮想VMを提案しているのだが、リソース効率が悪く...
まぁー１つのcryoSPARCで運用すれば？ってなりますが、、デー...
-R7(2025).9.13
RL9で pyqt4 の構築は無理っぽい..っというか単に当方の力不...
ChatGPTに課金した. その解答には概ね満足. っが結局は自分で...
-R7(2025).9.10
Rockylinux9に入れたphenixからpymolを呼び出したいのですが...
ならばとでpython27向けのpymolを作っているが、連携にpyqt4...
-R7(2025).9.1
chatGPTをよく使うようになった. 合っている時もあるけどそう...
-R7(2025).8.21
Teamviewer/AnyDesk経由でアクセスする際、計算機にモニター...
これを計算機に取り付けるとあたかもモニターが接続されてい...
-R7(2025).8.20
coot v1.1.x版をソースから作ってみた. flathubで容易に導入...
napari. プラグインが多々あるから自分の場所に入れた方がよ...
-R7(2025).8.16
AMDのVGAカードを調べた. RDNA2/RDNA3世代の製品においてROCm...
tensorflowはまだの様子. まだまだnvidia様ですなぁ. RTX PRO...
-R7(2025).8.15
rockylinux8で使えるUSB-LANアダプター「LUA5-U3-AGTE-WH/BK...
オリジナルの
-R7(2025).8.13
cryoSPARC v4.7.1 にパッチが出たみたい.
-R7(2025).8.12
調べていたら、、結局「Bootable Container Image」ってqemu...
libvrtでの仮想OSは中に入ってdnfでOSをメンテするけど、「Bo...
cryoSPARCなDockerfileがあれば、１台のマシンに最終的にはqe...
あるのはDockerfileの修正だけで仮想マシンが作れるよって感...
そのDockerfileだけど、kickstartで代替できるから...まぁDoc...
-R7(2025).8.11
「Bootable Container Image」を使えば仮想マシンのようにloc...
そうなると普通のdockerでは無理でしたcryoSPARCの複数contai...
これをcontainer化できれば、より多くのcryoSAPRCインスタン...
-R7(2025).8.9
ぁ、３連休なのね. 忘れてた.
-R7(2025).8.7
flathubにcoot 1.1.18が乗っていた. flatpakで構築できるとは...
-R7(2025).8.3
software-raidのmdadmの並列度を増す方法 「echo 16 > /sys/b...
nvme software-raidでGPUを使っての高速があるみたい. [[http...
-R7(2025).7.27
cephでHDD消費に偏りが発生. どうも「.mgr」プールがまずかっ...
「.mgr」は既定だとHDDとSSDを区別なく使うcrush ruleが適用...
「.mgr」にSSDを使うruleを適用したら自動的にrebalanceが機...
CBI学会年会に参加したいが高いなぁ...たまに勉強する機会を...
-R7(2025).7.25
topazだけど、python3.6とpytorch2の組み合わせは無理みたい....
ならpython3.6とtorch 1.xなら行けるが、torch 1.xは最新のnv...
以前はokだったのに最新nvidiaドライバだと無理かぁ.. Blackw...
-R7(2025).7.22
作業が遅く課題が積み上がる...Blackwell(50x0)カードを調達...
-R7(2025).7.18
RTX50向けな tensorflow の whlファイルが作れるみたい. ぁ、...
前言撤回
-R7(2025).7.17
Blackwell(50x0) だが、IsoNet, crYOLO, cryoCARE, deepEMhan...
未対応のtensorflowが使われているのが原因っぽい. 今後更新...
-R7(2025).7.11
アテロームが再発して....腰に発生. 正直なれているけどしん...
-R7(2025).7.9
今日からインターフェックスなのだが...参加したかった..
-R7(2025).7.4
BlackwellでcryoSPARC. master/worker共に v471-cuda12 にす...
570.26はMaxwell(GTX TITAN X, Quadro M6000とか), Pascal(GT...
-R7(2025).7.2
昨日から妙に腰が痛む...
-R7(2025).6.25
RL10でchimera, relionらを試さねば.. Xwaylandでこれらが描...
nfs4-acl-toolsが使いにくい..
-R7(2025).6.22
chimera-1.16 軽量なのでよく利用するのですが、nvidia 535 ...
ただ nvidia のインストールの際「NVIDIA-Linux-x86_64-570.1...
-R7(2025).6.20
cyroSPARC 4.7.1リリース. 4.7.1の枝番version"v4.7.1-cuda12...
OS側でGLIBC 2.28以上なので rockylinux8(glibc 2.28) ubuntu...
枝番じゃない 4.7.1 へのupdateは今までの継承(要nvidia 520...
-R7(2025).6.19
ipmi越しにOSの再インストール. 「Virtual Media」にisoを定...
その場合はnetbootの要領で進める. [[参照>+https://www.serv...
今回も不参加. 積み上がった課題を只管こなしている.
-R7(2025).6.14
6.11にrockylinux10(RL10)がリリースされたみたい. kernalが6...
Pythonは3.12ベースへとかとか [[https://docs.rockylinux.or...
-R7(2025).6.10
体調不良. 事務所でお仕事. OS更新に伴うdockerの移行を考え...
docker saveでtarを作ってそれを新OSに持って行って docker l...
-R7(2025).6.8
macOSにanaconda/minicondaを敷いてconda create/installをす...
-R7(2025).5.22
napari-cryoloの構築でエラーが出た. 関連パッケージのversio...
-R7(2025).5.21
freeipaでsmbを要するにはdomain参加が必要だが、パスワード...
これまで通りsmbpasswdで定義したパスワードでsmbアクセスは...
-R7(2025).5.14
freeipaをやっている. ntlm無効の局面に備えて勉強中. ログイ...
暫くすると再発する. mountオプションをsec=krb5からsec=sys...
-R7(2025).5.3
centos7に570.xxx(12.8)、565.xxx、560.xxx(12.6)、555.xxx(1...
-R7(2025).5.1
私用で不在です.
-R7(2025).4.26
VMware ESXiが再度無償版となって使えるそうな. Proxmoxに移...
無償版がv8.0から. v7.0とは画面構成が若干違うみたい.
-R7(2025).4.23
cephadmでsambaコンテナを使えるべくテストを続けているが、...
どこかのノードでcephをmountして、そこでsmbを出せば事足り...
-R7(2025).4.18
cryoSPARC の最新版がでて1week. パッチ提供らはない模様で大...
AMD GPU の Radeon でrelionは動くそうな. ちょいと試してみ...
-R7(2025).4.10
cryoSPARC 4.7.0がリリースされました. 心よりお祝い申し上げ...
っがリリース直後ってパッチ提供がすぐあるのが最近の傾向. 1...
-R7(2025).4.7
r9.4にてssh接続が遅い.
「GSSAPIAuthentication no」で回避. あとdns resolvの問題. ...
-R7(2025).4.3
もうちょい休む.
-R7(2025).3.31
年度末. 疲れました. 休みます.
-R7(2025).3.25
37.2微熱
-R7(2025).3.22
cifsでautofs.
auto.masterはいつも通り.
auto.homeは「/OffloadData -fstype=cifs,credentials=/etc/c...
-R7(2025).3.20
ubuntu24.04を扱っている. 画面にgnome-terminalが立ち上がら...
MotionCor2がlibtiff.so.5を求める. ubuntu24.04はlibtiff.so...
「/usr/local/」に入れとけばいいみたい.
-R7(2025).3.17
win10マシンを更新するかぁ...まだまだ十分に使えるのだが..
-R7(2025).3.15
software-RAIDで6本のHDDでRAID5を構築したら「cat /proc/mds...
っが、暫くして「UUUUUU」となる. RAID6ならはなっから「UUUU...
32core, 64coreとかあるならsoftwareRAIDでも良くね？って思...
-R7(2025).3.8
アテロームは切開手術せず、市販薬で抑えられるか試したら、...
手術は超ブルーで落ち込み、10日ほど毎日通院. ３月はさすが...
Rocky9で「transparent_hugepage=never」をgrubに仕込んでも...
-R7(2025).3.4
beegfsのmeta向けSSDのi-nodeが溢れて機能停止. 62Mのi-node...
別途SSDを「-i 2048」でmkfs.ext4して、490Mのi-nodeに増やし...
「rsync -a」ではxattrが移らない. 「rsync -aX」で移せるが...
-R7(2025).2.28
アテローム再発. 歩くと痛い. 忙しい時に再発である..
-R7(2025).2.15
rockylinux8ではcryoSPARCにて「io_uring」のWARNINGが表示さ...
なので対応のしようがない. rockylinux9に上げるか、ELRepoの...
-R7(2025).2.13
cephにwindowsクライアントアプリがあるのね. [[https://clou...
これでsmbを立てなくても行けるか.
-R7(2025).2.12
OpenIDを作りたくなってきた.
-R7(2025).2.8
cryoSPARCでデータベースが正しく起動しない件.
そのデータベースがnfs先にあるなら file lock 機構が効いて...
-R7(2025).2.3
先週、食あたりを受けた. 今も微妙..
-R7(2025).1.8
topaz v0.3.5が出てたので改定. 「3D particle-picking」がで...
いずれはmasterに統合なのでしょうけど、触ってみたい方に.
-R7(2025).1.1
謹賀新年
21世紀も四分の１かぁ. 昭和100年. 大正114年. 明治158年. 平...
-R6(2024).12.26
また風邪になったみたい..
-R6(2024).12.24
腰痛が復活？
-R6(2024).12.22
すごいなぁ. Boltz-1 [[https://jclinic.mit.edu/boltz-1/>+h...
AF3の精度を有する3D予測アプリ. 学術、商用問わず利用可能の...
-R6(2024).12.17
ジョブ管理にGrid Engineを使っているサイトでcryoSPARC. ジ...
updateのたびに修正かぁ...
-R6(2024).12.15
VirtualGLでvncを動かしたら画面が真っ黒. まれにあるみたい....
lightdmはディスプレイサーバ Wayland に現状未対応. ディス...
-R6(2024).12.13
ChimeraX 1.9リリース
-R6(2024).12.5
relion-5.0.0リリースおめでとうございます.
とある理由でEMPIARのデータが必要になった. 本家ではAspera...
なのでPDBj様でEMPIARのデータを取得. rsyncで取れるのが嬉し...
-R6(2024).12.4
とある場所でcryoSPARCのデータベースが復旧不可能になった. ...
既存のプロジェクトディレクトリをattach操作したら一応は復...
-R6(2024).11.30
風邪の症状が治まった. 咳はほとんど出てない. ようやく終わ...
っで寝込んでいた時に気の迷いでボタンを押したteslaのカード...
-R6(2024).11.20
引き続き絶賛(ry. 寝込んでいてebayを見ていたら10x0時代のt...
-R6(2024).11.19
絶賛風邪の中. cryoSPARC v4.6.2がリリース.
-R6(2024).11.18
とあるところでcryoSPARCのClass2DがGPUが落ちた.「export CR...
ネタは[[ここ>+https://discuss.cryosparc.com/t/assistance-...
-R6(2024).11.16
風邪ひいた..
-R6(2024).11.15
cryoSPARCを動かすホストの名称は全て小文字で構成された方が...
大文字を含むホスト名とipがあれば無事起動できたのだが、v4....
-R6(2024).11.14
cryoSPARC v4.6.1がリリース. 例の2DClassで落ちる現象も対処...
-R6(2024).11.12
AlphaFold3がリリースされたのね. 開発元は A100(80GB), H100...
4090/3090の24GBカードでもRAMを借用すれば動かすことが可能...
ユニファイドメモリーならmacOSも手なのだろうか？
-R6(2024).11.11
ひたすらcentos7->rockylinux8,9に揚げている. PXEbootでOSを...
結局ひとつひとつOS更新を行っている. 20,30台ならPXEbootな...
-R6(2024).11.6
slurm-webを作ってみた. squeue で足りそうな気がする.
vmware esxiの代替先としてProxmoxを使っている. 高度な使い...
-R6(2024).10.28
cgroups v2対応なOSは Ubuntu21.10以降(22.04LTSとか), RHEL9...
openPBSのgitを眺めていると ubuntu24 に対応とかあるけど、...
slurmはv1 v2とも対応済みの様子.
-R6(2024).10.19
ローカルにpostfixを立ててSMTPリレーをさせてみた. office36...
結構ハードルが高かったので断念. 代わりに回線プロバイダのS...
mobaXtermでcootが機能しない時がある. その際はmobaXtermのX...
-R6(2024).10.16
adaptecの8シリーズでmaxviewのメール設定を検討中. 中身はJa...
office365のSMTPは利用できない. TLS(SSL)なしの送信が許可さ...
ローカルにpostfixを立てて、そこを踏み台にoffice365へ転送...
-R6(2024).10.11
cryoSPARCのcluster運用にて. masterはジョブを発行するとき...
masterは停止、workerはそのまま働かせる. これなら行けるっ...
「Job is unresponsive - no heartbeat received in 180 seco...
workerを動かしている最中、masterも動いてないとダメらしい....
-R6(2024).10.8
cryoSPARC v4.6.0で2Dclassの際に落ちる. [[これ>+https://di...
kernelパラメータの調整が必要ってoracleかよ.
-R6(2024).9.27
アテローム発生...
-R6(2024).9.26
samba-ad関連の記事をupdate予定.
-R6(2024).9.25
samba-adとの接続でrockylinux8ならnslcd経由で行けたのに ro...
仕方ないので sssd経由にしたのだが、こちらユーザデータにpo...
samba-adで作ったアカウントにposixAccountは入ってなく別途...
-R6(2024).9.21
ルータ内にWireGuardを仕込めるかテストをしているのだが.......
firewall-cmdのexternal/trustedな仕掛けのまま使いたいのが...
-R6(2024).9.14
またヘルニアを痛めた模様。一応歩けるけど、前屈みすると痛...
長時間椅子に座ったから？ これじゃ仕事できないよぉ.. 連...
esxiの後釜としてProxmoxを使いだした. esxiで作った仮想マシ...
加えてGPUも使えて. なぜかesxiだと535までだったのがそれ以...
-R6(2024).9.11
cryoSPARC v4.6.0リリース. リリースノートを読むとこれがcen...
-R6(2024).9.5
[[VirtualGL]]を試している. 以前よりももっと簡単に動かせれ...
srunでリソースを確保してdockerにVirtualGLを仕立てれば、、...
-R6(2024).9.1
coot公式配布を無理やりRHEL9で動かしてみた. openssl-1.0.2...
-R6(2024).8.30
気が付けば葉月も終わり. 夏は暑い外と寒い鯖室の出入りで調...
cootの公式配布バイナリがRHEL8系までなのでRHEL9系向けを作...
まぁmac/winでcootが多いの需要は少ないのですが.
-R6(2024).7.26
階段を下りると痺れがでる. 普段の歩行は問題ないかな.
debパッケージの作り方を勉強中.
-R6(2024).7.15
Multi-Instance GPU(MIG)に興味を持ったが、TeslaのA30かA100...
GPUをインスタンス毎に分けて使える. virtualGLとかにも分け...
無理なのでp100かv100でも買おうかな.
-R6(2024).7.4
右脚の痺れは残っているけど、腰痛が厳しくなってきた. 右脚...
esxiでnvidia-550とか555が機能しない. 535なら大丈夫.
-R6(2024).6.25
ほぼ二か月が経過. 歩行に支障はない. 痺れはあるけど無視で...
anacondaを使われている所でminiforge/miniconda系への移行が...
-R6(2024).6.12
仕事に出かけたのだが、帰りはタクシーで帰宅. 右脚の痺れは...
また腰の部分に痛みが出てきた. 変な姿勢で歩いているのが原...
GAMESSを取り扱い始めた. mopac以来かな.
-R6(2024).6.5
あら cryoSPARC v4.5.3 がリリースです.
-R6(2024).6.4
一か月が過ぎた. ようやく歩ける(当社比1/2). ゆっくりなら行...
cryoSPARC v4.5.2がリリース
-R6(2024).5.27
3週間過ぎた. 当初痺れて10mも歩けなかったのが、リハビリと...
動きは酔歩に近いが動ける. 酔歩といえばMC...いやなんでもな...
-R6(2024).5.21
理学療法士様によるリハビリを受けた. 静養しつつリハビリ運...
お薬で痺れ痛みが緩和され、辛かった病院通いが随分と楽にな...
-R6(2024).5.20
relion5の連携condaアプリですが、relion5の更新に合わせて連...
relion5のsubtomogramでEMPIAR-10164のmrcはブラウザからとれ...
ここなのね ftp.ebi.ac.uk/empiar/world_availability/10164/...
-R6(2024).5.17
患って今日で２週間がたった. 今月中の外出は難しいかなぁ..
-R6(2024).5.15
整形外科に行ってレントゲン撮った. 坐骨神経痛が確定っぽい....
RHEL9系でcootをコンパイルできないか調査中.
手始めにRHEL7系のCentOS7でcootをコンパイルしてみているが...
-R6(2024).5.9
外出を試みるもほんの十数メートルで断念. 1week安静したけど...
ほんと歩けない....
-R6(2024).5.9
あら cryoSPARC v4.5.1 がリリースです. バグフィックスですね.
絶賛 坐骨神経痛は継続中. ほんと歩けない.. 毎日安静してます.
-R6(2024).5.8
cryoSPARC v4.5がリリース. [[https://cryosparc.com/updates...
引き続き坐骨神経痛で歩けないです...
-R6(2024).5.5
やばい..坐骨神経痛っぽい...歩けない..
-R6(2024).4.30
風邪ひいて38度まで上がった. ようやく平熱に戻ったけど喉が...
-R6(2024).4.25
CentOS7で800x600しか出なかった. っでelrepoのkernelに差し...
最新cpuの内蔵videoってcentos7は未対応？
-R6(2024).4.17
通院の毎日. ようやく多少座れるようになった.
-R6(2024).4.10
椅子には座れるけど、長時間は無理. 通院してガーゼ交換です...
-R6(2024).4.8
また切開手術...肩とは別の箇所.
-R6(2024).4.5
cryoSPARCのキャッシュについて. クラスターで運用すると時に...
計算ノードは固定しない. なのでキャッシュもどんどん分散さ...
っで終わっても消してくれないので運用上の悩みとなる。BeeON...
-R6(2024).4.4
Bioconductor 3.19はR-4.4向け. Bioconductor 3.19は5/1にリ...
-R6(2024).4.3
ubuntu22.04のrelionにて relion_python_* から「libcuda.so...
「/etc/ld.so.conf.d/」に/usr/local/cudaも入っているのだが...
仕方ないので modulefiles/relion で/usr/local/cudaを優先に...
毎日通院. 切開箇所のガーゼ交換なのですが、めちゃくちゃ痛...
-R6(2024).4.1
肩の方を切開手術.
-R6(2024).3.30
GPUマシンで計算が途中で止まるなら..
1.GPUのwattをdown 2.BIOSでPCIe GENを1にdown 3.kernelをup....
kernel upで成功したらwattをup, genをupして速度を上げてみ...
-R6(2024).3.28
病院行って切開は様子見.
-R6(2024).3.26
肩に傷ができて痛む..あと吹き出物も再発..今週中に病院かな...
-R6(2024).3.23
usbを刺してデータ転送をするとwaitが上がる. usbがダーティ？
linuxに刺す前にwinに刺して整合性を取ってみるのは意味があ...
-R6(2024).3.21
報告書ラッシュ. 寒の戻りなためか体が微妙.. 外出は取りやめ...
relion-5.0-beta-2がリリースされていた.
-R6(2024).3.15
確定申告,青色申告,消費税申告がやっと完成. 本日提出へ.
-R6(2024).3.11
cephのquotaを試したのだが...制限設置に10Giと定義できると...
判明するのに半日かよ..修練が足らない.
-R6(2024).3.6
CTFFIND5をコンパイル中. バイナリーは既に提供されてますが...
ctffind5を単体で用意してみたくてコンパイル中.
-R6(2024).3.4
締め切りに追われてます.
cryoSPARCのホスト名ですが、大文字でホスト名を持たせるなら...
小文字なら/etc/hostsはそのままでもok. 小文字ホスト名の方...
-R6(2024).3.1
2月は結構きつかった. 3月も相当な感じ. cootのrhel9系向けの...
-R6(2024).2.16
そうか. ハーゲンダッツを買う日か.
cryoSPARCにてupdateを実行しての何も動かない時はLD_LIBRARY...
-R6(2024).2.14
だいぶ楽になりました.
-R6(2024).2.13
nfsボリュームに対するACL(nfs4_setfacl/nfs4_getfacl)を試し...
今週いっぱい外勤しないつもり. 今時点階段を上るときっつい..
-R6(2024).2.10
PyMOL. tagのv2.5.0はRockylinuxでコンパイルできるけど、最...
look_atなるコマンドでコンパイルが落ちる. glm-develを上げ...
-R6(2024).2.9
吹き出物が再発して手術. 3,4日はあまり動けないかな. 以前も...
椅子に座ってのディスクワークには支障がないけど、外勤は厳...
-R6(2024).2.8
coot使うなら rockylinux8.x だなぁ. ubuntu22.04でもcootは...
ソースコードが公開されているから作れなくはないのでしょう...
nfsサーバは64GB メモリーかなぁ.
-R6(2024).2.6
REHL(本家)9.3を取得した. いわゆる個人向けで使うなら16台ま...
あくまでも個人向け. 事業とかそれを使って成果を出すなら本...
パッケージリポジトリが全く違っていたのに驚いて急遽議題に...
-R6(2024).2.2
ldapはfailover,ppolicy,lamの組み込み、slurmはslurmdbdとXD...
rootパスワは破棄かな. 管理者権限アカウントの創設とsudo. c...
zabbixとceph,mail連携. fail2ban. slurmにprolog/epilogを入...
-R6(2024).2.1
nfs client側でaclを付けたいと思った. nfs4-acl-toolsのnfs4...
cephfsはsetfaclコマンドで定義できるのだがnfs clientでsetf...
-R6(2024).1.30
ldapでアカウント管理. それにautomountも管理させたくてldap...
運用もいいのだが、台数が増えると集中管理がいいかなと. ま...
-R6(2024).1.28
LdapAdminのLinux版があった. これでldifを作らんでも楽に操...
このLdapAdmin(linux版)、Xmingでは微妙、mobaXtermならok. X...
-R6(2024).1.22
でっかいファイルシステムを構築中. いつも間にか手に汗がに...
system diskって実はext4にしてパーティションを動かせた方が...
-R6(2024).1.21
supermicroのMBでIPMI経由によるOS再インストールを試した. ...
SFT-DCMS-Singleライセンス(有償)が必要みたい.. 以前は追加...
gpartedで領域を小さくしようと思ったらxfsはダメ見たい. ext...
-R6(2024).1.19
仕事積みすぎた..土日で片付かせたい..
-R6(2024).1.10
次期リリースのphenix-1.21からMOPACが使えるとは...驚いた.
しかもMOPAC自体がオープンソースになっていてこれも驚いた.
-R6(2024).1.9
cephのreef. cephfsのみだけど手順確認. backendのcluster ne...
次はcephadmの習得かな.
-R6(2024).1.8
年始年末をcephの勉強に充てている. 以前Octopus(v15.x)で作...
cephadmの利用を前提としたdashboardが気になりますが、一通...
今後はcephadmベースで進むのでしょうが、docker/podmanの上...
こころはドキュメントをよく読んで進むしかないかなぁ.
-R6(2024).1.7
動作検証にvmware esxiを使っている. ebayでTeslaP40(GP102[G...
nvidiaの仮想GPUが使えそうなのよねぇ
-R6(2024).1.1
謹賀新年. 未達な課題が多くてすみません.
なんでまほよ?その前に月の裏側では.....
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