cryoSPARC/project をテンプレートにして作成
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開始行:
$HOMEにcryoなるフォルダを用意して
#code(nonumber){{
setfacl -m user:cryosparc:rx $HOME
setfacl -m user:cryosparc:rx $HOME/cryo
setfacl -dm user:cryosparc:rxw $HOME/cryo
setfacl -dm user:$USER:rxw $HOME/cryo
}}
とcryoSPARCサービスの稼働ユーザcryosparcに書き込み権限を...
LVMやzfs、btrfs、cephらを駆使しつつ $HOME を単一ボリュー...
別のボリュームにも移したい事がある.
例えば
/home/$USER
から
/home2/$USER
にとか.
ここではそのようなデータ移動について記載します
***同一インスタンス内での移動 [#s96fded4]
参照先 [[https://guide.cryosparc.com/setup-configuration-...
cryoSPARCでは「&color(magenta){project directory};」と称...
&size(10){その１つの「&color(magenta){project directory};...
cryoSPARC 3とかなら「P1」「P2」とかでしょうか. 最近では「...
同一インスタンス内での移動は
-対象のプロジェクトをArchiveして
-対象のフォルダを別の場所に移動
-cryoSPARCから unArchive を実行
これで別の場所にプロジェクト ディレクトリが移動できます.
注意点としては、移動先のフォルダがcryoSPARCサービスで参照...
画面を用いて説明すれば、異動対象のプロジェクトを選択して...
&ref(2023y08m28d_031408373.png,nolink);
その後、OKを選択して
&ref(2023y08m28d_031710119.png,nolink);
最終確認画面に移ります. そこでこのプロジェクトのIDを入力...
&ref(2023y08m28d_031725731.png,nolink);
cryoSPARC画面はそのままプロジェクトは残ってますが、「Arch...
&ref(2023y08m28d_032245626.png,nolink);
次に、実際のファイルシステム側での作業となります.
今回は $HOME/cryo から $HOME/cryo2 へ移動を想定します. な...
#code(nonumber){{
mkdir $HOME/cryo2
setfacl -m user:cryosparc:rx $HOME/cryo2
setfacl -dm user:cryosparc:rxw $HOME/cryo2
mv $HOME/cryo/CS-rc-sample-run $HOME/cryo2/
}}
で移動させます.
っで最後にまたcryoSPARC画面にてファイルシステムでデータを...
&ref(2023y08m28d_032431492.png,nolink);
OKかの選択を経て
&ref(2023y08m28d_032633676.png,nolink);
移動させたデータの場所を指定します。ここではフォルダ名を...
&ref(2023y08m28d_032809321.png,nolink);
これで移動は完了です
これは同一のインスタンス. 同じcryoSPARCデータベース内での...
***別のインスタンスへの移動 [#n65e19ec]
参照先 [[https://guide.cryosparc.com/setup-configuration-...
別のインスタンスへの移動は
-対象のプロジェクトをdetachして
-対象のフォルダを別の場所に移動
-cryoSPARCから attach を実行
で行えます。この際数字番号な「P1」「P2」とかの数字は異な...
***メモ [#td0c605a]
今あるプロジェクトのリスト
#code(nonumber){{
cryosparcm cli "list_projects()" | sed "s/'/\"/g" | sed "...
cryosparcm cli "list_projects()" | sed "s/'/\"/g" | sed "...
}}
で閲覧可能. 結果はこんな感じかな
#code(nonumber){{
"P1","/home/cryosparc/P1","sample"
"P2","/home/cryosparc/P2","ABC"
}}
っでこれをdetachの場合は「cryosparcm cli "detach_project(...
移した後でのatacheは「attach_project(owner_user_id: str, ...
なので
#code(nonumber){{
cryosparcm cli "attach_project('64c2f47e09e87fxxxxxxxxxx...
}}
とかでしょうか.
以上は detach-attachの場合。
~
前段の archive-unarchive は同一マシン内のでフォルダ移動で...
#code(nonumber){{
cryosparcm cli "archive_project('P1')"
<フォルダのcopy>
cryosparcm cli "unarchive_project('64c2f47e09e87fyyyyyyy...
}}
でしょうか.
終了行:
$HOMEにcryoなるフォルダを用意して
#code(nonumber){{
setfacl -m user:cryosparc:rx $HOME
setfacl -m user:cryosparc:rx $HOME/cryo
setfacl -dm user:cryosparc:rxw $HOME/cryo
setfacl -dm user:$USER:rxw $HOME/cryo
}}
とcryoSPARCサービスの稼働ユーザcryosparcに書き込み権限を...
LVMやzfs、btrfs、cephらを駆使しつつ $HOME を単一ボリュー...
別のボリュームにも移したい事がある.
例えば
/home/$USER
から
/home2/$USER
にとか.
ここではそのようなデータ移動について記載します
***同一インスタンス内での移動 [#s96fded4]
参照先 [[https://guide.cryosparc.com/setup-configuration-...
cryoSPARCでは「&color(magenta){project directory};」と称...
&size(10){その１つの「&color(magenta){project directory};...
cryoSPARC 3とかなら「P1」「P2」とかでしょうか. 最近では「...
同一インスタンス内での移動は
-対象のプロジェクトをArchiveして
-対象のフォルダを別の場所に移動
-cryoSPARCから unArchive を実行
これで別の場所にプロジェクト ディレクトリが移動できます.
注意点としては、移動先のフォルダがcryoSPARCサービスで参照...
画面を用いて説明すれば、異動対象のプロジェクトを選択して...
&ref(2023y08m28d_031408373.png,nolink);
その後、OKを選択して
&ref(2023y08m28d_031710119.png,nolink);
最終確認画面に移ります. そこでこのプロジェクトのIDを入力...
&ref(2023y08m28d_031725731.png,nolink);
cryoSPARC画面はそのままプロジェクトは残ってますが、「Arch...
&ref(2023y08m28d_032245626.png,nolink);
次に、実際のファイルシステム側での作業となります.
今回は $HOME/cryo から $HOME/cryo2 へ移動を想定します. な...
#code(nonumber){{
mkdir $HOME/cryo2
setfacl -m user:cryosparc:rx $HOME/cryo2
setfacl -dm user:cryosparc:rxw $HOME/cryo2
mv $HOME/cryo/CS-rc-sample-run $HOME/cryo2/
}}
で移動させます.
っで最後にまたcryoSPARC画面にてファイルシステムでデータを...
&ref(2023y08m28d_032431492.png,nolink);
OKかの選択を経て
&ref(2023y08m28d_032633676.png,nolink);
移動させたデータの場所を指定します。ここではフォルダ名を...
&ref(2023y08m28d_032809321.png,nolink);
これで移動は完了です
これは同一のインスタンス. 同じcryoSPARCデータベース内での...
***別のインスタンスへの移動 [#n65e19ec]
参照先 [[https://guide.cryosparc.com/setup-configuration-...
別のインスタンスへの移動は
-対象のプロジェクトをdetachして
-対象のフォルダを別の場所に移動
-cryoSPARCから attach を実行
で行えます。この際数字番号な「P1」「P2」とかの数字は異な...
***メモ [#td0c605a]
今あるプロジェクトのリスト
#code(nonumber){{
cryosparcm cli "list_projects()" | sed "s/'/\"/g" | sed "...
cryosparcm cli "list_projects()" | sed "s/'/\"/g" | sed "...
}}
で閲覧可能. 結果はこんな感じかな
#code(nonumber){{
"P1","/home/cryosparc/P1","sample"
"P2","/home/cryosparc/P2","ABC"
}}
っでこれをdetachの場合は「cryosparcm cli "detach_project(...
移した後でのatacheは「attach_project(owner_user_id: str, ...
なので
#code(nonumber){{
cryosparcm cli "attach_project('64c2f47e09e87fxxxxxxxxxx...
}}
とかでしょうか.
以上は detach-attachの場合。
~
前段の archive-unarchive は同一マシン内のでフォルダ移動で...
#code(nonumber){{
cryosparcm cli "archive_project('P1')"
<フォルダのcopy>
cryosparcm cli "unarchive_project('64c2f47e09e87fyyyyyyy...
}}
でしょうか.
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