xray/計算機環境

ネットワーク図†

想定するネットワーク図

ファイルサーバ†

FreeNASでも機能(ファイル鯖、アカウント管理)は満たせる。
MacOSXServerだとクライアントにMacがあれば望ましい選択肢の一つ。強力なアカウント管理機構を持つ。
あとCalendar Serverで皆のスケジュール把握とか、機器予約とか。

計算ノード†

ファイルサーバの共有フォルダをマウントして各種の計算を実施して、結果を残す。
計算プログラム自体もファイルサーバに置けば、容易にマシン交換によるスケールアップが可能

クライアント†

■windows
自分の共有ドライブをネットワークドライとしてＺドライブにさせ、windows対応ccp4、pymol、cootらで
計算、モデリングを行う。
加え、tera-termらで計算ノードにログインして、コマンドラインレベルのジョブを実行。
さらにXmingなどのＸ端末ソフトを使い、計算ノードにXDMCPで入って、GUIベースのアプリケーションを操作する。
Office環境/メール環境との連携が容易い

■Linux
自分の共有フォルダはNFSにより常に使える状態。
基本的に計算ノードと同じ処理をローカルマシンで実行できる。

御品書き
■samba(更新) DNS
win参加 lin参加
ユーザ登録(1,2)
ホームディレクトリ
共有フォルダ(1)
VSS DC追加 GPO SSO
透過的ファイル圧縮
Server-Side Copy
ルータ超え 時刻同期
ログオンスクリプト
NAS参加(1) NFS DFS
Mac参加(NFS)
ownCloud
リモートディスクトップ
ディスクトップ
smb3マルチチャンネル
backup
メモ OpenAM
samba/LDAP XP
RSAT nisでsmb
admin-tools

■FreeIIPA
サーバ nfs
client ユーザ登録
パスワードポリシー

■ＬＤＡＰ
構築 参照 登録 接続
qnap smb 複数smb
smbldap-passwd
バックアップ UpGrade
ldapAccountManager
memberOf ApacheDirectoryStudio

■windowsServer
ユーザ登録 Lin参加
nfsサーバ

■windows11
WSLg CUDA
WSL-RockyLinux
■windows10
WSL2

■nis nfs
nis with kerberos

■ＡＰＰＬＥ
ユーザ管理 LDAP .
X11 VNC ODBC
Fink MacPorts Xcode
TimeMachine GCC uid
仮想化

■電顕
Relion Frealign
EMAN2 ctffind
MotionCor2 Gctf
Gautomatch
Xmipp Scipion
cisTEM cryoSPARC
ChimeraX IMOD
ResMap em2em
Focus
Appion Leginon
OpenSerialEM
画像変換
Gwatch silo Eos
CueMol crYOLO
Warp Fiji
CCP-EM
TranSPHIRE
Cinderella
JANNI
Bsoft gP2S
PyTom Dynamo
emClarity
SIDESPLITTER
topaz
ISAC
PyEM
cryoDRGN 3DFSC
EPU_group_AFIS
DeepEMhancer
MiRPv2 servalcat
Deepfinder
reliosparc
SPRING
ModelAngelo

■ジョブ管理
OpenPBS slurm
TORQUE SGE
parallel

■Ｘ線結晶構造解析
立体視
ccp4 coot PyMOL
cns Phenix XDS
KAMO
Amber MicroED

■構造式検索
RDKit(Cartridge,DB)
OpenBabel(Cartridge,DB構築,登録)
SciTouchBingo
Depict CDK

■web
dhtmlx wdCalendar CMS SharePoint httpd nginx certbot japan-map pukiwiki

■AERS

■データベース
●FileMaker
●MSSQL(鯖,蔵)
●ORACLE

■仮想化
docker VMware
Singularity
QEMU libvirt vm作成
vmHDD拡張 oVirt
bridge-net

■ストレージ
MegaRAID
AdaptecRAID
LVM soft-RAID(1)
HighAvailability

■ファイルシステム
NFS
Ceph
btrfs,OpenZFS,GFS2
OCFS2,Lustre,
BeeGFS,GlusterFS(2)
xfs CacheFS
LizardFS DRBD
OrangeFS
Gfarm
ACL

■言語
oneAPI
bash
CUDA NVIDIA
Ｒ
python
Jupyter
Java
php PhpSpreadsheet
gcc devtoolset
OpenMPI

■アプリ管理
EnvironmentModules

■リモートアクセス
NoMachine
vnc noVNC
xrdp Remmina
VirtualGL
Guacamole
WireGuard
OpenVPN
TeamViewer AnyDesk
ssh

■X11
Xming VcXsrv
仮想フレームバッファ

■ファイル転送
lsyncd Aspera
inotify-tools
encryption
progress
rsync

■Bio
Alphafold
localcolabfold
RoseTTAFold
RaptorX-3DModeling
MODELLER
namd gromacs
I-TASSER

■コード管理
Jetty GitBucket

■システム管理
ipmi cacti Zabbix
Nagios Hinemos
IPMIView snmp
Webmin

visudo
ntp
dhcp dnsmasq
Radius

■firewall
iptables router

■(XML系)
xmllint

■(他)
cygwin Browse
全文検索 Top 矩形貼付
UnixBench wget
pandoc
Remmina
Rocket.Chat
pigz

■OS
RockyLinux9
CentOS8
CentOS(メモ,2,3,4)
CentOS6 yum
ubuntu(zfs)
FreeBSD
kickstart Ansible
proxy リポジトリ
FreeNAS,NAS4Free

■未分類
リンクサーバ
MySQL削除
CalenderServer
ooffice自動 pt2
認証 bind
アプリケーション配置
地域メッシュコード

DiCE

瑣末なこと
isoファイル
不良セクタの直し方
消えたNIC mail

■バックアップ
rsnapshot,VTL,LTFS
Bacula

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